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Community Partner Highlight - INER
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jnywong authored Oct 30, 2024
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blogpost: true
date: Oct 28, 2024
author: Katie Pratt (CSCCE), Sabrina López (MetaDocencia)
tags: Community Partners
language: English
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# Community Partner Highlight - Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER)

*This blog post is part of a series highlighting the [Catalyst Project’s Community Partners](../current-community-partners.md), who are using the Catalyst Project cloud infrastructure to further various projects in the biosciences. Community Partners also play a vital role in shaping our governance model to help us sustain, scale and maximise impact in Latin America, Africa, and under-served communities around the world.*

In this blog post, Yalbi I. Balderas-Martinez shares how partnering with the Catalyst Project is impacting the [Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER)](http://iner.gob.mx) in México.

**Could you introduce yourself to our readers? Tell us about your organisation/institute/project and the research the members of your community are working on right now.**

Our community is called INER, as we work at the National Institute of Respiratory Diseases in México City. We are interested in research and in medical education. For example, we are working on an institutional project related to pulmonary thromboembolism (PTE) detection using a Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM) dataset.

We are using the Catalyst Platform to implement machine learning algorithms that will classify radiology images, with a view to improving patient outcomes. This project is also being used to teach medical students how artificial intelligence can be implemented in a public clinical environment. In this project, we are projecting that more than 15 people are going to be included.

:::{pull-quote}
"The Catalyst Project is helping us to collaborate more efficiently and work remotely."
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**What are you specifically using the cloud infrastructure for? What kinds of data are stored there? What software packages does your community use?**

At this moment this is a local collaboration, involving three departments at INER. We use Python with PyTorch, as well as different machine-learning models. We use a DICOM dataset, `.jpg` and `.csv` files.

The Catalyst Project is enabling our community to work more efficiently and collaboratively, and we are also planning to use the platform for implementing AI workshops.

**Can you tell us about your experience with the Catalyst Project so far? E.g., have you participated in any training options through Catalyst? What have you enjoyed most so far?**

We have been participating in all of the [training](../training.md) offered by Catalyst, including the Hub Champion Training, Carpentries Instructor Training delivered by MetaDocencia, and the OLS Open Seeds program.

:::{figure} ../images/blog/community-partner-highlights/iner.png
:alt: A screenshot of a Zoom meeting with the INER team.
A screenshot of the INER-Catalyst Team collaborating remotely thanks to the Catalyst Project.
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*Photo courtesy of Yalbi I. Balderas-Martinez.*
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blogpost: true
date: Oct 28, 2024
author: Katie Pratt (CSCCE), Kevin Cabana, (MetaDocencia), Sabrina López (MetaDocencia)
tags: Comunidades asociadas
language: Español
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# Comunidad Asociada Destacada - Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER)

*Esta publicación es parte de una serie que destaca a [las Comunidades asociadas del Proyecto Catalyst](../current-community-partners.md), quienes están utilizando la infraestructura en la nube del Proyecto Catalyst para avanzar en diversos proyectos en las biociencias. Nuestras Comunidades asociadas también juegan un papel vital en la configuración de nuestro modelo de gobernanza, ayudándonos a sostener, escalar y maximizar el impacto en América Latina, África y comunidades desatendidas en todo el mundo.*

En este post, Yalbi I. Balderas-Martínez comparte cómo la colaboración con el Proyecto Catalyst está impactando al Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER) en México.

**¿Podrías presentarte a nuestros lectores? Cuéntanos sobre tu organización/instituto/proyecto y sobre la investigación en la que está trabajando actualmente tu comunidad.**

Nuestra comunidad se llama INER, ya que trabajamos en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias en la Ciudad de México. Nos enfocamos en la investigación y en la educación médica. Por ejemplo, actualmente estamos trabajando en un proyecto institucional relacionado con la detección de tromboembolismo pulmonar (TEP) utilizando un conjunto de datos DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine).

Estamos usando la Plataforma Catalyst para implementar algoritmos de aprendizaje automático que clasifiquen imágenes de radiología, con el objetivo de mejorar los resultados de los pacientes. Este proyecto también se utiliza para enseñar a los estudiantes de medicina cómo se puede implementar la inteligencia artificial en un entorno clínico público. Estimamos que más de 15 personas participarán en este proyecto.

:::{pull-quote}
"El Proyecto Catalyst nos está ayudando a colaborar de manera más eficiente y a trabajar de forma remota."
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**¿Qué uso específico le están dando a la infraestructura en la nube? ¿Qué tipo de datos almacenan allí? ¿Qué paquetes de software utiliza tu comunidad?**

En este momento, esta es una colaboración local que involucra a tres departamentos en el INER. Utilizamos Python con PyTorch, así como diferentes modelos de aprendizaje automático. Trabajamos con un conjunto de datos DICOM, archivos `.jpg` y `.csv`.

El Proyecto Catalyst nos está permitiendo trabajar de manera más eficiente y colaborativa, y también estamos planeando utilizar la plataforma para implementar talleres de inteligencia artificial.

**¿Podrías contarnos cómo fue hasta ahora tu experiencia con el Proyecto Catalyst? Por ejemplo, ¿has participado en alguna capacitación ofrecida por Catalyst? ¿Qué es lo que has disfrutado más?**

Hemos participado en todas [las capacitaciones](../training.md) ofrecidas por Catalyst, incluidas la formación para Campeones y Campeonas del Hub, la capacitación para Instructores/as de The Carpentries ofrecida por MetaDocencia y el programa OLS Open Seeds.

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:alt: A screenshot of a Zoom meeting with the INER team.
Captura de pantalla del equipo INER-Catalyst colaborando de manera remota gracias al Proyecto Catalyst.
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*Foto cortesía de Yalbi I. Balderas-Martinez.*
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