-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
Merge pull request #106 from czi-catalystproject/blog-highlight-intro
Add introduction to community partner hightlights
- Loading branch information
Showing
2 changed files
with
184 additions
and
0 deletions.
There are no files selected for viewing
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Original file line number | Diff line number | Diff line change |
---|---|---|
@@ -0,0 +1,92 @@ | ||
--- | ||
blogpost: true | ||
date: Oct 28, 2024 | ||
author: Katie Pratt (CSCCE), Sabrina López (MetaDocencia) | ||
tags: News | ||
language: English | ||
--- | ||
|
||
# Introducing the Catalyst Project Community Partner Highlights | ||
|
||
*The Catalyst Project is a community-engaged initiative designed to support the adoption of open science principles in under-served bioscientific research communities through the provision of reliable and sustainable cloud computing infrastructure. It’s a project we’ve been working on now for almost two years, which involves staff from seven different organizations: [2i2c](https://2i2c.org/),, [The Carpentries](https://carpentries.org/about/), [CCAD](https://ccad.unc.edu.ar/), [CSCCE](https://www.cscce.org/), [IOI](http://investinopen.org/), [MetaDocencia](http://metadocencia.org/), and [OLS](http://openlifesci.org/), and is funded by the Chan Zuckerberg Initiative.* | ||
|
||
A key part of the project is engaging with Community Partners in Africa and Latin America: Institutions, organizations, and individuals who are undertaking bioscientific research projects that require cloud computing infrastructure. As collaborators on the Catalyst Project, Community Partners can access and use 2i2c’s open science cloud services, and also receive training from 2i2c, The Carpentries, MetaDocencia, and OLS to support their work. [Community Partners](../current-community-partners.md) also play a vital role in shaping an evolving governance model for the Catalyst Project to help sustain, scale, and maximize impact in Latin America, Africa, and under-served communities around the world. | ||
|
||
In a new collection of blog posts (that we hope will expand over the next couple of months!) we’re highlighting the work of the Catalyst Project Community Partners. This post is a gateway to learning more about the Catalyst Project and its Community Partners. If you have any questions or feedback about the project, please [send an email to the core team](../contact.md). | ||
|
||
## Highlighting the Catalyst Project Community Partners | ||
|
||
The Catalyst Project currently involves 19 Community Partners, 9 in Africa and 10 in Latin America. Our initial blog post series showcases seven of the Partners, and each post is available in English and Spanish: | ||
|
||
::::{grid} 1 1 1 1 | ||
:::{grid-item-card} African Institute of Biomedical Science and Technology (AiBST) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/aibst-logo.jpg | ||
At the African Institute of Biomedical Sciences and Technology (AiBST) in Zimbabwe, Zedias Chikwambi and colleagues are working to discover and utilise biomarkers to guide personalized medical treatment. | ||
|
||
*"Through the Catalyst Project we are able to bring genomic information interpretation to patient bedsides." - Zedias Chikwambi* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-aibst-en.md) | [ES](./community-highlight-aibst-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Malawi University of Science and Technology (MUST) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/must-logo.png | ||
The Catalyst Project Community at the Malawi University of Science and Technology (MUST) is working to popularize the applicability of data science and artificial intelligence in various undergraduate and postgraduate research contexts in Malawi, including health, business, and education. | ||
|
||
*“...many staff and students need… a robust and easily accessible platform from which they can efficiently run their machine learning models and do advanced data analysis for their data science research…” - Bennett Kankuzi* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-must-en.md) | [ES](./community-highlight-must-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} MolerHealth | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/molerhealth-logo.png | ||
MolerHealth is focused on revolutionizing healthcare in Nigeria by developing an accessible electronic health record (EHR) system aimed at reducing disease misdiagnosis. | ||
|
||
*“Access to training, like The Carpentries Instructor Training, has empowered our team with essential skills for effective teaching and collaboration.” - Monsurat Onabajo* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-molerhealth-en.md) | [ES](./community-highlight-molerhealth-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Nelson Mandela African Institution of Science and Technology (NM-AIST) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/nm-aist-logo.png | ||
The Northern Tanzania One Health Research Group, hosted at the Nelson Mandela African Institution of Science and Technology (NM-AIST), is using the Catalyst Cloud Infrastructure to understand the transmission dynamics, genetic diversity, and antimicrobial resistance of the Mycobacterium tuberculosis complex (Mtb) between humans and livestock in Northern Tanzania. | ||
|
||
*“...access to training, particularly through the 2i2c Hub Champion Training, has significantly enhanced our ability to manage and optimize cloud-based resources." - Beatus M Lyimo* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-nmaist-en.md) | [ES](./community-highlight-nmaist-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/unam-logo.jpg | ||
The Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG) of the Centro de Ciencias Genómicas (CCG) - Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) is a group that brings together professionals and academics to support, provide services, and maintain the growth of the field of bioinformatics in the country's research. | ||
|
||
*“(Our) goal is to optimize our participation in events, assess the usefulness of the Catalyst Project's resources, and, in turn, provide the Catalyst Project with guidelines to improve their service by identifying the necessary areas for improvement within the institutions." - Shirley Alquicira Hernández* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-nnbccg-en.md) | [ES](./community-highlight-nnbccg-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/iner-logo.jpeg | ||
Collaborators at INER are using the Catalyst Cloud Infrastructure to implement machine learning algorithms that will classify radiology images of pulmonary thromboembolism (PTE), with a view to improving patient outcomes. | ||
|
||
*"The Catalyst Project is helping us to collaborate more efficiently and work remotely." - Yalbi I. Balderas-Martinez* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-iner-en.md) | [ES](./community-highlight-iner-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Centro Interdisciplinario en Ciencia de Datos y Aprendizaje Automático (CICADA) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/cicada-logo.png | ||
CICADA, an interdisciplinary center researching data science and machine learning, is using the Catalyst CLoud Infrastructure to analyze Uruguayan population data to understand patterns of migration, how much of the native footprint remains, and what can be said about the people who lived in the Uruguayan territory before the arrival of Europeans. | ||
|
||
*"The Catalyst Project…trainings are attractive, as they are respectful of the people, no previous knowledge is assumed, and the instructors are welcoming.” - María Inés Fariello Rico"* | ||
+++ | ||
Read more: [EN](./community-highlight-cicada-en.md) | [ES](./community-highlight-cicada-es.md) | ||
::: | ||
:::: | ||
|
||
## About the blog posts – Acknowledgements | ||
|
||
Creating a series of blog posts to highlight the work of the Catalyst Community Partners was a collaborative effort involving staff from CSCCE, 2i2c, OLS, and MetaDocencia. Specifically, Lou Woodley, Katie Pratt, Jenny Wong, and Tajuddeen Gwadabe conceived the idea during our regular Catalyst Project “website team” meetings, and developed a strategy for reaching out to community partners to gather information. | ||
|
||
Katie then led that outreach, which involved a representative of each Community Partners completing a Google Form to answer three key questions and sharing a photo (or a selection of photos) to use on the blog. Katie curated all of the information, edited together the blog posts, and secured sign-off from all of the partners. Sabrina López and her team at MetaDocencia coordinated the translation of the posts from English to Spanish, and Jenny formatted and published them on the website. | ||
|
||
We’re grateful to the Community Partners for generously sharing more about their work – and we look forward to highlighting more Catalyst Project Community Partners soon! |
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Original file line number | Diff line number | Diff line change |
---|---|---|
@@ -0,0 +1,92 @@ | ||
--- | ||
blogpost: true | ||
date: Oct 28, 2024 | ||
author: Katie Pratt (CSCCE), Kevin Cabana (MetaDocencia), Sabrina López (MetaDocencia) | ||
tags: Novedades | ||
language: Español | ||
--- | ||
|
||
# Presentando a las Comunidades Asociadas Destacadas del Proyecto Catalyst | ||
|
||
*El Proyecto Catalyst es una iniciativa comunitaria diseñada para apoyar la adopción de los principios de ciencia abierta en comunidades de investigación biocientífica subatendidas, a través de la provisión confiable y sostenible de infraestructura de computación en la nube. Es un proyecto en el que hemos estado trabajando durante casi dos años, involucrando al personal de siete organizaciones diferentes: [2i2c](https://2i2c.org/), [The Carpentries](https://carpentries.org/about/), [CCAD](https://ccad.unc.edu.ar/), [CSCCE](https://www.cscce.org/), [IOI](http://investinopen.org/), [MetaDocencia](http://metadocencia.org/), y [OLS](http://openlifesci.org/), y financiado por la Chan Zuckerberg Initiative (en español, Iniciativa Chan Zuckerberg* | ||
|
||
Una parte clave del proyecto es la colaboración con Comunidades Asociadas en África y América Latina: instituciones, organizaciones e individuos que están llevando a cabo proyectos de investigación biocientífica que requieren infraestructura de computación en la nube. Como colaboradores del Proyecto Catalyst, las Comunidades Asociadas pueden acceder y utilizar los servicios de ciencia abierta en la nube de 2i2c, y también recibir capacitación de 2i2c, The Carpentries, MetaDocencia y OLS para apoyar su trabajo. [Las Comunidades Asociadas](../current-community-partners.md) también desempeñan un papel fundamental en la formación de un modelo de gobernanza en evolución para el Proyecto Catalyst, ayudando a garantizar su sostenibilidad, escalabilidad y máximo impacto en América Latina, África y otras comunidades subatendidas en todo el mundo. | ||
|
||
En una nueva colección de publicaciones (que esperamos expandir en los próximos meses), estamos destacando el trabajo de las Comunidades Asociadas del Proyecto Catalyst. Esta publicación es una puerta de entrada para conocer más sobre el Proyecto Catalyst y sus Comunidades Asociadas. Si tienes alguna pregunta o comentario sobre el proyecto, [por favor, envía un correo al equipo central.](../contact.md) | ||
|
||
## Destacando a las Comunidades Asociadas del Proyecto Catalyst | ||
|
||
El Proyecto Catalyst actualmente involucra a 19 Comunidades Asociadas, 9 en África y 10 en América Latina. Nuestra serie inicial de publicaciones presenta a siete de estos socios, y cada publicación está disponible tanto en inglés como en español: | ||
|
||
::::{grid} 1 1 1 1 | ||
:::{grid-item-card} African Institute of Biomedical Science and Technology (AiBST) (en español, Instituto Africano de Ciencias Biomédicas y Tecnología) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/aibst-logo.jpg | ||
En AiBST, en Zimbabue, Zedias Chikwambi y sus colegas están trabajando para descubrir y utilizar biomarcadores que guíen el tratamiento médico personalizado. | ||
|
||
*""Gracias al Proyecto Catalyst, podemos llevar la interpretación de la información genómica a las camas de los pacientes." - Zedias Chikwambi* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-aibst-en.md) | [ES](./community-highlight-aibst-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Malawi University of Science and Technology (MUST) (en español, Universidad de Ciencia y Tecnología de Malawi) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/must-logo.png | ||
La Comunidad del Proyecto Catalyst en la Malawi University of Science and Technology (MUST) está trabajando para popularizar la aplicabilidad de la ciencia de datos y la inteligencia artificial en diversos contextos de investigación de pregrado y posgrado en Malawi, incluidos salud, negocios y educación. | ||
|
||
*"...muchos miembros del personal y estudiantes necesitan... una plataforma robusta y fácilmente accesible desde la cual puedan ejecutar de manera eficiente sus modelos de aprendizaje automático y realizar análisis avanzados de datos para sus investigaciones en ciencia de datos..." - Bennett Kankuzi* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-must-en.md) | [ES](./community-highlight-must-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} MolerHealth | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/molerhealth-logo.png | ||
MolerHealth se centra en revolucionar la atención médica en Nigeria mediante el desarrollo de un sistema de registros electrónicos de salud (EHR, por las siglas en inglés de electronic health record) accesible, con el objetivo de reducir los diagnósticos erróneos de enfermedades. | ||
|
||
*"El acceso a capacitaciones, como la de Instructor de The Carpentries, ha empoderado a nuestro equipo con habilidades esenciales para una enseñanza y colaboración efectiva." - Monsurat Onabajo* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-molerhealth-en.md) | [ES](./community-highlight-molerhealth-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Nelson Mandela African Institution of Science and Technology (NM-AIST) (en español, Instituto Africano de Ciencia y Tecnología Nelson Mandela) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/nm-aist-logo.png | ||
El Grupo de Investigación One Health en el Norte de Tanzania, alojado en el instituto NM-AIST, está utilizando la infraestructura de la nube del Proyecto Catalyst para comprender la dinámica de transmisión, la diversidad genética y la resistencia a los antimicrobianos del complejo Mycobacterium tuberculosis (Mtb) entre humanos y ganado en el norte de Tanzania. | ||
|
||
*"...el acceso a la formación, especialmente a través de la Capacitación de Hub Champion de 2i2c, ha mejorado significativamente nuestra capacidad para gestionar y optimizar los recursos en la nube." - Beatus M Lyimo* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-nmaist-en.md) | [ES](./community-highlight-nmaist-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/unam-logo.jpg | ||
El Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG) del Centro de Ciencias Genómicas (CCG) - Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) es un grupo que reúne a profesionales y académicos para apoyar, brindar servicios y mantener el crecimiento del campo de la bioinformática en la investigación del país. | ||
|
||
*“(Nuestro) objetivo es optimizar nuestra participación en eventos, evaluar la utilidad de los recursos del Proyecto Catalyst, y, a su vez, proporcionar al Proyecto Catalyst directrices para mejorar su servicio, identificando las áreas necesarias de mejora dentro de las instituciones." - Shirley Alquicira Hernández* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-nnbccg-en.md) | [ES](./community-highlight-nnbccg-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/iner-logo.jpeg | ||
Los colaboradores del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER) están utilizando la infraestructura en la nube de Catalyst para implementar algoritmos de aprendizaje automático para clasificar imágenes radiológicas de tromboembolismo pulmonar (TEP), con el objetivo de mejorar los resultados para los pacientes. | ||
|
||
*""El Proyecto Catalyst nos está ayudando a colaborar de manera más eficiente y a trabajar de forma remota." - Yalbi I. Balderas-Martinez* | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-iner-en.md) | [ES](./community-highlight-iner-es.md) | ||
::: | ||
|
||
:::{grid-item-card} Centro Interdisciplinario en Ciencia de Datos y Aprendizaje Automático (CICADA) | ||
:img-top: ../images/community-partner-logos/cicada-logo.png | ||
CICADA, un centro interdisciplinario que investiga ciencia de datos y aprendizaje automático, está utilizando la infraestructura de la nube del Proyecto Catalyst para analizar datos de la población uruguaya con el fin de comprender los patrones de migración, cuánto del legado nativo permanece y qué se puede decir sobre las personas que vivieron en el territorio uruguayo antes de la llegada de los europeos. | ||
|
||
*"Los entrenamientos del Proyecto Catalyst son atractivos, ya que son respetuosos con las personas, no se asume conocimiento previo, y los instructores son acogedores." - María Inés Fariello Rico * | ||
+++ | ||
Lee más: [EN](./community-highlight-cicada-en.md) | [ES](./community-highlight-cicada-es.md) | ||
::: | ||
:::: | ||
|
||
## Acerca de estas publicaciones – Agradecimientos | ||
|
||
Crear una serie de publicaciones para destacar el trabajo de las Comunidades Asociadas del Proyecto Catalyst fue un esfuerzo colaborativo que involucró al personal de CSCCE, 2i2c, OLS y MetaDocencia. Específicamente, Lou Woodley, Katie Pratt, Jenny Wong y Tajuddeen Gwadabe concibieron la idea durante nuestras reuniones regulares del equipo del "sitio web" del Proyecto Catalyst, y desarrollaron una estrategia para contactar a los socios comunitarios para recopilar información. | ||
|
||
Katie lideró el contacto, que involucró a un representante de cada Comunidad Asociada completando un formulario de Google para responder tres preguntas clave y compartir una foto (o una selección de fotos) para usar en el blog. Katie reunió toda la información, editó las publicaciones del blog y se aseguró de tener la aprobación de todos los participantes. Sabrina López coordinó la traducción de las publicaciones de inglés al español, y Jenny las formateó y publicó en el sitio web. | ||
|
||
Agradecemos a las Comunidades Asociadas por compartir generosamente más sobre su trabajo, ¡Y esperamos destacar más Comunidades del Proyecto Catalyst pronto! |