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GuyliannEngels committed Dec 4, 2019
1 parent e601ec7 commit f28494d
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47 changes: 44 additions & 3 deletions README.md
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@@ -1,6 +1,6 @@
# Biométrie de *Paracentrotus lividus* Lamarck (1816)

## Introduction
## Avant-propos

Les données employées dans le cadre de cette étude proviennent des recherches du professeur Philippe Grosjean portant sur la croissance de *Paracentrotus lividus* Lamarck (1816).

Expand All @@ -10,12 +10,18 @@ Vous trouverez des informations importantes depuis R comme ceci :
?urchin_bio
```

## Instructions
Il est possible que ce document évolue au cours du temps. N'hésitez pas à aller vérifier le lien suivant afin de voir les modifications dans les consignes : https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_urchin_bio

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## Module 2

### Instructions

Vous pouvez vous inspirer d'un exemple d'analyse sur le jeu de données `iris`, voir [sdd1_iris](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_iris).


### Partie 1 : travail avec les scripts R
#### Partie 1 : travail avec les scripts R

- Ouvrez /R/urchin_bio.R

Expand All @@ -40,3 +46,38 @@ Vous pouvez vous inspirer d'un exemple d'analyse sur le jeu de données `iris`,
- Ajoutez une ou deux images dans votre introduction de rapport (vous trouverez ces images dans le sous-dossier `figures`).

- Citez la référence bibliographique qui se trouve dans le sous-dossier `bibliography`.

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## Module 3 & 4

### Etat de progression

A la fin de ce module, vous devez avoir décidé d'un but dans votre recherche. Il s'agit donc de se poser une question sur les données mise à votre disposition. Ajoutez au moins 3 graphiques pertinents en lien avec la question que vous vous posez. Chaque graphiques doit évidement être commenté dans le texte.

*note* Il n'est pas nécessaire de garder les 5 graphiques demandé lors du module 2. Vous devez gardez les graphiques les plus pertinents.

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## Module 5 & 6

### Etat de progression

A la fin de ce module, vous devez avoir intégré au moins un tableau qui résume vos données. Ce tableau doit être pertinent et en lien avec votre question de recherhce fixé lors des deux modules précédents.

Votre rapport écrit doit contenir les sections suivantes :

- une section introduction sur les organismes que vous étudiez
- une section but qui présente la question que vous vous posez sur ces données
- une section m&m courte qui présente l'acquisition des données
- une section résultats qui présente vos différents tableaux et graphiques
- une section discussion vide
- une section conclusion vide

## Module 7-8

### Etat de progression

A la fin de ce module, vous devez avoir progressé dans l'écriture de votre rapport. Si la réalisation d'un test de chi^2 se prête à la question de recherche que vous vous êtes posé, intégrez cette analyse statistique dans vos résultats

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