这是使用C/C++多线程为室友写的一个处理分子和原子的程序。
在其中ke_atom.100.dump文件中，每一列代表的是 原子的序号 原则的类型 原子的x坐标 原子的y坐标 原子的z坐标 原子的动能
现在要计算所有原子的平均动能。 其中每一个原子的动能计算方法是和这个原子相距不超过10的距离里，的所有原子的动能和除以原子的个数，表示这个原子的平均动能。
暴力法实现，为每一个原子都计算一次，这个耗时太长, 算法是O(n^2)级别
为所有的原子按照x坐标进行排序，这样如果x坐标超过10，就可以退出内层循环，提前结束循环，小于10则计算距离是否满足。
在实现2的基础上，检查y z 坐标，如果y z 坐标相差大于10，则不计算距离，直接continue，否则再进算距离，比步骤二速度提升很大。
按照实现3的想法，使用多线程，每个线程处理一段数据。这样效率会进一步加大很多。
后续又增加了很多类似的原子，只是原子的类型不同（其中携带的数据不同），但是还是距离小于10做什么事，距离大于10的直接跳过。所以为了使代码复用，这里将处理不同的原子放到不同的.h文件中，其中的框架部分放在main.c中，使用宏控制不同的原子类型形成了一个file文件夹。
现在只按照x坐标进行排序的话，符合x坐标的原子数量和满足距离小于10的比例大概是100比1。所以如何快速的排序原子坐标，或者有一种其他方法，直接选出范围更小的原子数量，再计算是否满足距离小于10的条件。
如果使用多进程程序，目前我遇到的问题是多进程如何按照顺序写入到一个文件中。 这里初步的想法是在父进程中打开文件，并建立共享内存给子进程，每个子进程中对共享内存的一部分进行处理，最后再由父进程按照id排序，再写入文件中。
后续部分增加了很多类似的需求，只是原子的类型不同，处理方式和计算方式不同。所以可以采用工厂模式，根据原子类型的不同生成不同的原子，用Template Method将算法和应用部分分离开。