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Rose-Delamare/GPS_data

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GPS_data

cleaning and processing GPS data
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Notice : Traitement des données GPS Hérisson

I – Choix des paramètres statiques

script : Test_balise.R
Tests statiques réalisés uniquement sur 1 balise
Ces tests permettent de déterminer l'erreur de localisation du GPS et de choisir les paramètres qui y sont corrélés et qui constituraient un critère pour déterminer des seuils au delà desquels les points GPS d'un suivi sont considérés comme faux.
Pour ornitella 30g : pas de paramètres type HDOP ou nombre sat retenus pour le moment (faiblement corrélés).
LE = 4 m

II – Formatage et nettoyage des données de suivi

1. Télécharger les données sur le site d’Ornitella et le mettre dans 1 dossier correspondant à l’individu (ex :Houmous)

  • 1 fichier .csv par période par balise
  • attention heure de début et de fin (se rapprocher le + possible)
  • numéroter les fichiers dans l’ordre chronologique

2. Appliquer les traitements
Script Fusion et nettoyage.R

  • tous les fichiers du dossier Houmous sont sélectionnés et traités en même temps
  • suppression des points sur les 12h après équipement individus
  • ajout colonne ‘Name’ et ‘RecOrig’
  • suppression doublons et nuls (= pas de coordonnées)
  • calcul IDtraj : nouveau trajet quand + de 10h entre 2 points (environ 1 traj / nuit)
  • ajout des coordonnées en UTM
  • création d’un nouveau fichier brut : Houmous_tot.csv

! ce fichier peut encore comporter des points dit 'aberrants', et ne différencie pas activité / repos

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