Les Rencontres R 2024 se sont tenues du 12 au 14 juin sur le campus de Tohannic à Vannes, France.
Les Rencontres R, portées par la Société Française de Statistique (SFdS), ont pour objectif d'offrir à la communauté francophone un lieu d'échange et de partage d'idées sur l'usage du langage R toutes disciplines confondues.
L'édition 2024 est co-organisée par l'IRISA, le LMBA et l'Université Bretagne-Sud. Elle s'adresse aussi bien aux débutants qu'aux utilisateurs confirmés et expérimentés issus de tous les secteurs d'activités.
Plus d'information : https://rr2024.sciencesconf.org
Twitter : @rencontres_R
LinkedIn : Rencontres R 🇫🇷
Chaine Youtube : @RencontresR | Playlist 2024
Les Rencontres R 2024 c'est :
-> 152 Participantes et participants
-> 5 Demi-journées
-> 5 Conférencières et conférenciers invité·e·s
-> 2 Tutoriels
-> 23 Présentations longues
-> 9 Lightning
-> 9 Posters dont 3 primés lors de ces rencontres
Les actes de la conférence des Recontres R 2024 sont disponsibles
Retrouvez le programme détaillé sur le site de la conférence.
- Apprendre R et les statistiques... grâce à R
- Philippe Grosjean, Service d’Écologie numérique, Instituts Infortech et Complexys, Université de Mons, Belgique
- Modératrice : Chloé Friguet - Comment tirer parti des technologies cloud sans se faire enfermer ? Projet Onyxia
- SK8 : Pour des applications shiny qui se déploient comment sur des roulettes - Modérateur : Paul Bastide
- Modélisation conjointe de données longitudinales et de temps d'événements sous R - Modératrice : Solène Desmée
- [R pour l'océano-météo et l'ingénierie marine](Présentations/02_Jeudi/01_Nicolas Raillard/Raillard_Nicolas_R pour l'océano-météo et l'ingénierie marine.pdf) - Modératrice : Audrey Poterie
- Dérivation automatique et optimisation avec la libraire torch - Tristan Mary-Huard, Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, UMR GQE-Le Moulon, 91190 Gif-sur-Yvette, France & Université Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, UMR MIA-Paris, 91120 Palaiseau, France
- Créez des environements reproductibles avec rix - Bruno Rodrigues, Ministère de la Recherche et de l’Enseignement supérieur au Luxembourg
- [hubeau: un package pour interroger les APIs du Système d'Information sur l'eau en France](Posters/01_Irz_Pascal_hubeau un package pour interroger les APIs du Système d'Information sur l'eau en France.pdf) - Pascal Irz, Direction régionale Bretagne
- SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny - Jean-François rey, Biostatistique et Processus Spatiaux - Élise Maigné, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
- Créer un site pour partager sa recherche avec R, blogdown et Hugo - Fanny Ollivier, Laboratoire de Psychologie des Pays de la Loire
- Les packages autour de JDemetra+ (rjd3) : une boîte à outils complète pour l'analyse des séries temporelles - Tanguy Barthelemy, INSEE
- [Poster autour du package {datamods}](Posters/05_Goumri_Samra_Poster autour du package {datamods}.pdf) - Samra Goumri, dreamRs - Victor Perrier, dreamRs
- [Distance/Divergence entre distributions t multivariées](Posters/06_Santagostini_Bouhlel_mstudentd_DistanceDivergence entre distributions t multivariées.pdf) - Pierre Santagostini, IRHS - Équipe ImHorPhen (Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage)
A survey translation tool to easily migrate from Qualtrics to LimeSurvey - Camille Straboni, Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris - [RecForest : Forêts aléatoires de survie pour l'analyse des événements récurrents en R](Posters/08_Murris_Juliette_RecForest Forêts aléatoires de survie pour l'analyse des événements récurrents en R.pdf) - Juliette Murris, Health data- and model- driven Knowledge Acquisition
- Des tableaux et des graphiques prêts à publication avec les packages R {tabularise} et {chart} de la suite SciViews - Guyliann Engels, Service d'écologie numérique, Institut Complexys & Infortech, Université de Mons, Cellule de Pédagogie Facultaire des Sciences, Université de Mons
: Prix du jury
- [Une enquête auprès des métiers de la « data » : quelle place pour R et ses utilisateurs ?](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/01_Girard_Antoine_Une enquête auprès des métiers de la « data » quelle place pour R et ses utilisateurs.pdf) - Antoine Girard, data analyst indépendant
- [Pour un namespace tout en souplesse](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/02_Floc'hlay_Swann_Pour un namespace tout en souplesse.html) - Swann Floc'hlay, ThinkR
- Cadre R chez IMPACT Initiatives - Yann Say, IMPACT Initiatives
- [Comment les communautés autour de R peuvent changer vos pRojets](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/05_Vaugoyeau_Marie_Comment les communautés autour de R peuvent changer vos pRojets.pdf) - Marie Vaugoyeau, MStats
- Explorer et comparer des cartes de zones climatiques locales avec le paquet lczexplore - Matthieu Gousseff, Equipe DECIDE
- [Des applications Shiny qui facilitent la vie](Présentations/02_Jeudi/05_Courte 2/02_Dechaux_Terence_Des applications Shiny qui facilitent la vie.pdf) - Terence Dechaux, Institut de l'élevage
- Application Shiny XPBlocs - Création de blocs en expérimentation - Maxime Legris, Institut de l'Elevage
- Utilisation du package {flexdashboard} pour le contrôle des données de biologie dans un entrepôt de données de santé - Morgane Pierre-Jean, Univ Rennes, CHU Rennes, INSERM, LTSI-UM R 1099
- easy16S : une application Shiny pour explorer ses données métagénomiques - Cédric Midoux, Université Paris-Saclay, INRAE, PROSE, 92160, Antony, France, Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France, Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France
- Un petit coup de polish - Nettoyage de fichiers Excel avec R - Thomas Vroylandt, Kantiles
- [{saperlipopette}, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité](Présentations/02_Jeudi/07_A101_Enseignement/02_Salmon_maelle_saperlipopette, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité.pdf) - Maëlle SALMON, rOpenSci, cynkra
- Génération aléatoire d'exercices de biostatistiques pour Moodle via le package SARP.Moodle de R - Emmanuel Curis, UR 7537 BioSTM, Faculté de pharmacie de Paris, Service d'Hématologie Biologique [CHU Lariboisière]
- [Extending code from the saemix package to fit parametric joint models in R](Présentations/01_Mercredi/02_Biostatistique/01_Comets_Emmanuelle_Extending code from the saemix package to fit parametric joint models in R.pdf) - Emmanuelle Comets, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution, Institut de recherche en santé, environnement et travail
- Mise en oeuvre de méthodes semi-Bayésiennes de calcul des erreurs standards pour les données éparses dans le package saemix - Mélanie Guhl, Université Paris Cité, INSERM, IAME, UMR 1137
- [BeQut, un package R pour l'estimation bayésienne de modèles de régression quantile à effets mixtes via JAGS](Présentations/01_Mercredi/02_Biostatistique/003_Barbieri_Antoine_BeQut, un package R pour l'estimation bayésienne de modèles de régression quantile à effets mixtes via JAGS.pdf) - Antoine Barbieri, Univ. Bordeaux, Inserm BPH U1219, F-33000, Bordeaux
- [telraamStats : visualisation des mobilités pour la recherche et les citoyen·ne·s](Présentations/02_Jeudi/02_Dataviz/01_Guichard-Sustowski_Ketsia_telraamStats visualisation des mobilités pour la recherche et les citoyen·ne·s.pdf) - Ketsia Guichard-Sustowski, Institut de Recherche Mathématique de Rennes, Centre de recherche en économie et management
- Collecter et cartographier les données du bilan carbone d'un congrès - Chloé Friguet, Université Bretagne Sud / IRISA et François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes
- [Sécurisation des analyses statistiques avec R : retour d'expérience](Présentations/02_Jeudi/07_A250_Gestion de projet/01_Philibert_Aurore_Dugas_Julien_Sécurisation des analyses statistiques avec R retour d'expérience.pdf) - Aurore Philibert, Pôle Biostatistique - Julien Dugas, Pôle Biostatistique
- [Refactoring : du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux](Présentations/02_Jeudi/07_A250_Gestion de projet/02_Guyader_Vincent_Refactoring du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux.html) - Vincent Guyader, ThinkR
- Une vie polyamoureuse entre R et Julia - Remy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann
- Estimation de quantiles conditionnels extrêmes : Package Extremefit - Gilles Durrieu, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique
- [Clustering sur données incomplètes avec clusterMI](Présentations/02_Jeudi/03_Méthode Statistique/02_Audigier_Vincent_Clustering sur données incomplètes avec clusterMI.pdf) - Vincent Audigier, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] : EA4629
- [Créer son propre package d'extension {recipes}: retour d'expérience de {scimo}](Présentations/02_Jeudi/03_Méthode Statistique/03_Bichat_Antoine_Créer son propre package d'extension recipes retour d'expérience de scimo.pdf) - Antoine Bichat, Les Laboratoires Servier
- Smooth testing and clustering of copulas - Yves Ismaël Ngounou Bakam, CREST-ENSAI
- [Garantir des analyses fiables avec les packages R : perspectives de la recherche clinique](Présentations/01_Mercredi/03_Reproductibilité/01_Féat_Yann_Guaranteeing reliable analyses with R packages perspectives from clinical research.pdf) - Yann Féat, mainanalytics GmbH
- Créez des environements reproductibles avec rix - Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
- Microstructure Information from Diffusion Imaging - Aymeric Stamm, Department of Mathematics Jean Leray
- [Esquisse, un outil de visualisation](Présentations/03_Vendredi/02_Shiny/02_Perrier_Victor_Esquisse, un outil de visualisation.pdf) - Victor PERRIER, dreamRs
- webR, et le futur des apps web avec R - Colin FAY, ThinkR
- Human in the deep: Converting research activities pressures into ecological impact assessment. - Riwan Leroux, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
- [Maturation de codes scientifiques R de traitement de données liées à l'Eau au BRGM (initiative MATUREAU)](Présentations/02_Jeudi/06_A250_Statistique pour l'environnement/02_Laurencelle_Marc_Maturation de codes scientifiques R de traitement de données liées à l'Eau au BRGM - initiative MATUREAU.pdf) - Marc Laurencelle, Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM)
- Un suivi régionalisé et actualisé des étiages des petits cours d'eau, c'est possible avec R, Hub'Eau et GitHub ! - Pascal Irz, Direction régionale Bretagne
- Baptiste ALGLAVE IUT SD, Univ. Bretagne-Sud, Lab-sticc, Vannes
- Anne CUZOL, IUT SD, Univ. Bretagne Sud, LMBA, Vannes
- Chloé FRIGUET IUT SD, Univ. Bretagne-Sud, IRISA, Vannes (présidente)
- Pierre GLOAGUEN, UFR SSI, Univ. Bretagne Sud, LMBA, Vannes (trésorier)
- Audrey POTERIE, IUT SD, Univ. Bretagne Sud, LMBA, Vannes
- François SEPTIER, UFR SSI, Univ. Bretagne Sud, LMBA, Vannes
- Pauline GORRE, IE appui à la Recherche/thématique IA, DRUID, Univ. Bretagne Sud, Vannes
- Antoine L'AZOU, gestionnaire, IRISA-CNRS, Rennes
- Aurélie JOUBEL, gestionnaire, LMBA, Univ. Bretagne Sud, Vannes
- Paul BASTIDE, IMAG-CNRS, Montpellier
- Vincent BRAULT, IUT SD, Univ Grenoble-Alpes, LJK, Grenoble (président)
- Marie CHION, University of Cambridge, UK
- Solène DESMEE, IUT GB, Univ. Tours, SPHERE-INSERM, Tours
- David GOHEL, Fondateur ARDATA, Paris
- François HUSSON, Institut Agro, IRMAR, Rennes
- Audrey POTERIE, IUT SD, Univ. Bretagne Sud, LMBA, Vannes
- Geneviève ROBIN, LaMME-CNRS Evry et Owkin, Paris
- Julie AUBERT - AgroParisTech
- Rémy DROUILHET - Université Grenoble Alpes
- Robin GENUER - Université de Bordeaux
- Francois HUSSON - Institut Agro, Rennes
- Julie JOSSE - INRIA, Montpellier
- Aurélie SIBERCHICOT - Université Lyon 1
Nous remercions les participantes et participants, les intervenantes et intervenants, les différents comités et nos sponsors.
Durant ces trois jours, nous avons fait des blocs en expérimentation, des [retours d'expérience](Présentations/02_Jeudi/03_Méthode Statistique/03_Bichat_Antoine_Créer son propre package d'extension recipes retour d'expérience de scimo.pdf), ce fut parfois dans des conditions extrêmes et nous avons fait des erreurs standards notamment pour les données éparses en touchant le fond. Mais un petit coup de polish et [saperlipopette](Présentations/02_Jeudi/07_A101_Enseignement/02_Salmon_maelle_saperlipopette, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité.pdf), on a pu [progresser en toute sérénité](Présentations/02_Jeudi/07_A101_Enseignement/02_Salmon_maelle_saperlipopette, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité.pdf). Petit à petit les petits cours d'eau ont formé des grandes rivières et au travers de zones climatiques locales a abouti sur une vraie [ingénierie marine](Présentations/02_Jeudi/01_Nicolas Raillard/Raillard_Nicolas_R pour l'océano-météo et l'ingénierie marine.pdf).
Nous avons aussi parlé de biologie et de santé, en restant [fiables](Présentations/01_Mercredi/03_Reproductibilité/01_Féat_Yann_Guaranteeing reliable analyses with R packages perspectives from clinical research.pdf) mais sans être trop [clinique](Présentations/01_Mercredi/03_Reproductibilité/01_Féat_Yann_Guaranteeing reliable analyses with R packages perspectives from clinical research.pdf) [tout en souplesse](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/02_Floc'hlay_Swann_Pour un namespace tout en souplesse.html) puisque nous avons créé des environnements reproductibles avec rix (deux fois). Nous avons formé une [communauté autour de R](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/05_Vaugoyeau_Marie_Comment les communautés autour de R peuvent changer vos pRojets.pdf), des clusters de copules voir parfois été dans une vie polyamoureuse avec Julia.
Si nous faisions [une enquête auprès des](Présentations/01_Mercredi/04_Courte 1/01_Girard_Antoine_Une enquête auprès des métiers de la « data » quelle place pour R et ses utilisateurs.pdf) participants autour des [posters](Posters/05_Goumri_Samra_Poster autour du package {datamods}.pdf), je suis sûr que beaucoup me diraient, [qu’une marche, c'est bien](Présentations/02_Jeudi/07_A250_Gestion de projet/02_Guyader_Vincent_Refactoring du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux.html), surtout dans des [forêts aléatoires de survie](Posters/08_Murris_Juliette_RecForest Forêts aléatoires de survie pour l'analyse des événements récurrents en R.pdf) mais apprendre R et les statistiques... grâce à R afin d’avoir des tableaux et des graphiques prêts à publication et de faire une génération aléatoire d'exercices pour Moodle tout en [étendant nos codes](Présentations/01_Mercredi/02_Biostatistique/01_Comets_Emmanuelle_Extending code from the saemix package to fit parametric joint models in R.pdf), c’est mieux.
Il est temps de prendre nos [distances](Posters/06_Santagostini_Bouhlel_mstudentd_DistanceDivergence entre distributions t multivariées.pdf) et de migrer loin de Vannes. Prenez votre SK8, votre bouteille d[’eau](Posters/01_Irz_Pascal_hubeau un package pour interroger les APIs du Système d'Information sur l'eau en France.pdf) et surtout votre torch afin d’éclairer le monde. Nous vous avons donné une boîte à outils complète pour l’analyse afin de diffuser l’image que le futur c’est avec R.