Pipeline simplificado para análise de Componentes Principais (PCA) de dados de transcriptômica, com geração automatizada de visualizações.
- PCA Automatizado: Cálculo eficiente de componentes principais
- Visualização: Gráfico de barras da variância explicada por PC
- Reprodutibilidade: Contêiner Docker com todas as dependências
nextflow run main.nf -profile docker \
--input_data assets/dados_transcriptoma.rds \
--pca_components 10
.
├── assets/ # Dados de entrada (formato .rds)
├── results/ # Saídas (PDF com gráficos + objetos R)
├── modules/
│ ├── pca_analysis.nf # Cálculo da PCA
│ └── plot_pcs.nf # Geração do gráfico
├── main.nf # Fluxo principal
└── nextflow.config # Configurações