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OdilonJulio/ProjetoNextFlowCurso2025

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📊 Análise PCA de Dados de Transcriptômica - Nextflow Pipeline

Pipeline simplificado para análise de Componentes Principais (PCA) de dados de transcriptômica, com geração automatizada de visualizações.

✅ Funcionalidades Implementadas

  • PCA Automatizado: Cálculo eficiente de componentes principais
  • Visualização: Gráfico de barras da variância explicada por PC
  • Reprodutibilidade: Contêiner Docker com todas as dependências

🛠️ Tecnologias Utilizadas

▶️ Execução Básica

nextflow run main.nf -profile docker \
  --input_data assets/dados_transcriptoma.rds \
  --pca_components 10

.
├── assets/           # Dados de entrada (formato .rds)
├── results/          # Saídas (PDF com gráficos + objetos R)
├── modules/
│   ├── pca_analysis.nf  # Cálculo da PCA
│   └── plot_pcs.nf      # Geração do gráfico
├── main.nf           # Fluxo principal
└── nextflow.config   # Configurações

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