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Uti404 edited this page Feb 20, 2024 · 15 revisions

MAP‐Cov Projekt DMA2024TeamA


Willkommen zu unserem DMA2024TeamA wiki!

Dieses Projekt wurde im Rahmen des Berufsbegleitender Online-Master „Biomedizinische Informatik und Data Science“ erstellt. Es zeigt die Datenaufbereitung, sowie die Datenverarbeitung und Analysen von synthetische Patientendaten aus synthetischen Daten.

Dieses Projekt befasst sich mit der Wahrscheinlichkeit an Covid-19 zu erkranken, dabei soll ein besonderes Augenmerk auf den Wohnort der Patienten gelegt werden.

  • Wie hängt die Bevölkerungsdichte mit dem Covid-19-Verlauf zusammen?
  • Welcher Zusammenhang besteht zwischen Wohnort (an der Küste) und Beatmung während der Covid-19-Erkrankung?
  • Über welche Parameter lässt sich ein schwerer COVID-19 Verlauf definieren?

Durch die Beantwortung der letzten Forschungsfrage soll ein serverity Score etabliert werden, welcher auch zur Beantwortung der anderen beiden Fragen herangezogen werden soll.

Mithilfe von Python und SQL Abfragen sollen die Forschungsfragen auf Basis der von GitHub Synthea bereitgestellten Daten analysiert werden. Zu diesem Zweck werden die Daten extrahiert und in einer Datenbank abgelegt. Im nächsten Schritt wird ein Data Warehouse erstellt, auf das zugegriffen wird um ein Factsheet mit den Daten zu erstellen, die für weitergehende Analysen genutzt werden. Begleitend wird ein Datenmanagementplan geführt.

Das Team besteht aus Jan-Erik Weixler, Christiane Vieweg, Ute Mauer und Alissia Kuhl und entwickelt unter der Anleitung von Maximilian Fünfgeld im Kurs Datenmanagement und Archivierung im Umfeld der Forschung im Master BIDS Programm der Graduate School Rhein-Neckar in Zusammenarbeit mit der Hochschule Mannheim.