-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
환경 구축.html
962 lines (929 loc) · 58.5 KB
/
환경 구축.html
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
<!DOCTYPE html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" lang="en" xml:lang="en"><head>
<meta charset="utf-8">
<meta name="generator" content="quarto-1.5.57">
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0, user-scalable=yes">
<meta name="author" content="hs.hwang">
<title>Chapter3. 환경 구축 – UBAI GUIDE BOOK</title>
<style>
code{white-space: pre-wrap;}
span.smallcaps{font-variant: small-caps;}
div.columns{display: flex; gap: min(4vw, 1.5em);}
div.column{flex: auto; overflow-x: auto;}
div.hanging-indent{margin-left: 1.5em; text-indent: -1.5em;}
ul.task-list{list-style: none;}
ul.task-list li input[type="checkbox"] {
width: 0.8em;
margin: 0 0.8em 0.2em -1em; /* quarto-specific, see https://github.com/quarto-dev/quarto-cli/issues/4556 */
vertical-align: middle;
}
/* CSS for syntax highlighting */
pre > code.sourceCode { white-space: pre; position: relative; }
pre > code.sourceCode > span { line-height: 1.25; }
pre > code.sourceCode > span:empty { height: 1.2em; }
.sourceCode { overflow: visible; }
code.sourceCode > span { color: inherit; text-decoration: inherit; }
div.sourceCode { margin: 1em 0; }
pre.sourceCode { margin: 0; }
@media screen {
div.sourceCode { overflow: auto; }
}
@media print {
pre > code.sourceCode { white-space: pre-wrap; }
pre > code.sourceCode > span { display: inline-block; text-indent: -5em; padding-left: 5em; }
}
pre.numberSource code
{ counter-reset: source-line 0; }
pre.numberSource code > span
{ position: relative; left: -4em; counter-increment: source-line; }
pre.numberSource code > span > a:first-child::before
{ content: counter(source-line);
position: relative; left: -1em; text-align: right; vertical-align: baseline;
border: none; display: inline-block;
-webkit-touch-callout: none; -webkit-user-select: none;
-khtml-user-select: none; -moz-user-select: none;
-ms-user-select: none; user-select: none;
padding: 0 4px; width: 4em;
}
pre.numberSource { margin-left: 3em; padding-left: 4px; }
div.sourceCode
{ }
@media screen {
pre > code.sourceCode > span > a:first-child::before { text-decoration: underline; }
}
</style>
<script src="site_libs/quarto-nav/quarto-nav.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-nav/headroom.min.js"></script>
<script src="site_libs/clipboard/clipboard.min.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-search/autocomplete.umd.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-search/fuse.min.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-search/quarto-search.js"></script>
<meta name="quarto:offset" content="./">
<link href="./Python 실행.html" rel="next">
<link href="./접속 방법.html" rel="prev">
<script src="site_libs/quarto-html/quarto.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-html/popper.min.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-html/tippy.umd.min.js"></script>
<script src="site_libs/quarto-html/anchor.min.js"></script>
<link href="site_libs/quarto-html/tippy.css" rel="stylesheet">
<link href="site_libs/quarto-html/quarto-syntax-highlighting.css" rel="stylesheet" id="quarto-text-highlighting-styles">
<script src="site_libs/bootstrap/bootstrap.min.js"></script>
<link href="site_libs/bootstrap/bootstrap-icons.css" rel="stylesheet">
<link href="site_libs/bootstrap/bootstrap.min.css" rel="stylesheet" id="quarto-bootstrap" data-mode="light">
<script id="quarto-search-options" type="application/json">{
"location": "sidebar",
"copy-button": false,
"collapse-after": 3,
"panel-placement": "start",
"type": "textbox",
"limit": 50,
"keyboard-shortcut": [
"f",
"/",
"s"
],
"show-item-context": false,
"language": {
"search-no-results-text": "No results",
"search-matching-documents-text": "matching documents",
"search-copy-link-title": "Copy link to search",
"search-hide-matches-text": "Hide additional matches",
"search-more-match-text": "more match in this document",
"search-more-matches-text": "more matches in this document",
"search-clear-button-title": "Clear",
"search-text-placeholder": "",
"search-detached-cancel-button-title": "Cancel",
"search-submit-button-title": "Submit",
"search-label": "Search"
}
}</script>
</head>
<body class="nav-sidebar floating">
<div id="quarto-search-results"></div>
<header id="quarto-header" class="headroom fixed-top">
<nav class="quarto-secondary-nav">
<div class="container-fluid d-flex">
<button type="button" class="quarto-btn-toggle btn" data-bs-toggle="collapse" role="button" data-bs-target=".quarto-sidebar-collapse-item" aria-controls="quarto-sidebar" aria-expanded="false" aria-label="Toggle sidebar navigation" onclick="if (window.quartoToggleHeadroom) { window.quartoToggleHeadroom(); }">
<i class="bi bi-layout-text-sidebar-reverse"></i>
</button>
<nav class="quarto-page-breadcrumbs" aria-label="breadcrumb"><ol class="breadcrumb"><li class="breadcrumb-item"><a href="./환경 구축.html"><span class="chapter-title">Chapter3. 환경 구축</span></a></li></ol></nav>
<a class="flex-grow-1" role="navigation" data-bs-toggle="collapse" data-bs-target=".quarto-sidebar-collapse-item" aria-controls="quarto-sidebar" aria-expanded="false" aria-label="Toggle sidebar navigation" onclick="if (window.quartoToggleHeadroom) { window.quartoToggleHeadroom(); }">
</a>
<button type="button" class="btn quarto-search-button" aria-label="Search" onclick="window.quartoOpenSearch();">
<i class="bi bi-search"></i>
</button>
</div>
</nav>
</header>
<!-- content -->
<div id="quarto-content" class="quarto-container page-columns page-rows-contents page-layout-article">
<!-- sidebar -->
<nav id="quarto-sidebar" class="sidebar collapse collapse-horizontal quarto-sidebar-collapse-item sidebar-navigation floating overflow-auto">
<div class="pt-lg-2 mt-2 text-left sidebar-header">
<div class="sidebar-title mb-0 py-0">
<a href="./">UBAI GUIDE BOOK</a>
</div>
</div>
<div class="mt-2 flex-shrink-0 align-items-center">
<div class="sidebar-search">
<div id="quarto-search" class="" title="Search"></div>
</div>
</div>
<div class="sidebar-menu-container">
<ul class="list-unstyled mt-1">
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./index.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">MAIN</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./UBAI Cluster.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">UBAI Cluster</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./계정 생성.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">Chapter1. 계정 생성</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./접속 방법.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">Chapter2. 접속 방법</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./환경 구축.html" class="sidebar-item-text sidebar-link active"><span class="chapter-title">Chapter3. 환경 구축</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./Python 실행.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">Chapter4. Python 실행</span></a>
</div>
</li>
<li class="sidebar-item">
<div class="sidebar-item-container">
<a href="./파일 로드.html" class="sidebar-item-text sidebar-link"><span class="chapter-title">Chapter5. 파일 관리</span></a>
</div>
</li>
</ul>
</div>
</nav>
<div id="quarto-sidebar-glass" class="quarto-sidebar-collapse-item" data-bs-toggle="collapse" data-bs-target=".quarto-sidebar-collapse-item"></div>
<!-- margin-sidebar -->
<div id="quarto-margin-sidebar" class="sidebar margin-sidebar">
<nav id="TOC" role="doc-toc" class="toc-active">
<h2 id="toc-title">Table of contents</h2>
<ul>
<li><a href="#linux-환경-설정" id="toc-linux-환경-설정" class="nav-link active" data-scroll-target="#linux-환경-설정">1. Linux 환경 설정</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#module-avail" id="toc-module-avail" class="nav-link" data-scroll-target="#module-avail">1.1 Module avail</a></li>
<li><a href="#module-show" id="toc-module-show" class="nav-link" data-scroll-target="#module-show">1.2 Module show</a></li>
<li><a href="#module-load" id="toc-module-load" class="nav-link" data-scroll-target="#module-load">1.3 Module load</a></li>
<li><a href="#module-list" id="toc-module-list" class="nav-link" data-scroll-target="#module-list">1.4 Module list</a></li>
<li><a href="#module-rm" id="toc-module-rm" class="nav-link" data-scroll-target="#module-rm">1.5 Module rm</a></li>
<li><a href="#module-purge" id="toc-module-purge" class="nav-link" data-scroll-target="#module-purge">1.6 Module purge</a></li>
</ul></li>
<li><a href="#python-환경-설정" id="toc-python-환경-설정" class="nav-link" data-scroll-target="#python-환경-설정">2. Python 환경 설정</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#minicoda-설치" id="toc-minicoda-설치" class="nav-link" data-scroll-target="#minicoda-설치">2.1 Minicoda 설치</a></li>
<li><a href="#minicoda-실행" id="toc-minicoda-실행" class="nav-link" data-scroll-target="#minicoda-실행">2.2 Minicoda 실행</a></li>
</ul></li>
<li><a href="#enroot" id="toc-enroot" class="nav-link" data-scroll-target="#enroot">3. Enroot</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#enroot-컨테이너-기능" id="toc-enroot-컨테이너-기능" class="nav-link" data-scroll-target="#enroot-컨테이너-기능">3.1 Enroot 컨테이너 기능</a></li>
<li><a href="#image와-container" id="toc-image와-container" class="nav-link" data-scroll-target="#image와-container">3.2 Image와 Container</a></li>
<li><a href="#enroot-가상환경-실행" id="toc-enroot-가상환경-실행" class="nav-link" data-scroll-target="#enroot-가상환경-실행">3.3 Enroot 가상환경 실행</a></li>
</ul></li>
</ul>
</nav>
</div>
<!-- main -->
<main class="content" id="quarto-document-content">
<header id="title-block-header" class="quarto-title-block default">
<div class="quarto-title">
<h1 class="title"><span class="chapter-title">Chapter3. 환경 구축</span></h1>
</div>
<div class="quarto-title-meta">
</div>
</header>
<p>환경 구축은 프로젝트의 안정적이고 효율적인 진행을 위한 핵심적인 단계입니다.</p>
<p>특히 다양한 운영체제(OS), 프레임워크, 라이브러리 간의 버전 차이는 예상치 못한 충돌과 오류를 일으킬 수 있어 사전 예방이 중요합니다.</p>
<p>이러한 문제를 방지하기 위해 프로젝트마다 독립된 환경을 구축하여 각 요소의 버전을 관리하는 것이 필수적입니다.</p>
<p>가상환경을 활용하면 각 프로젝트에 적합한 버전의 OS, 라이브러리, 패키지 등을 자유롭게 설치하고 관리할 수 있으며, 프로젝트 간에 서로 영향을 주지 않도록 독립적인 환경을 보장할 수 있습니다. 그리고 이를 통해 다양한 환경 설정을 실험하거나 손쉽게 유지보수할 수 있게 됩니다. 특히 공동 작업 시, 동일한 환경을 공유하여 호환성을 높이고 버전 차이에 따른 문제를 최소화할 수 있습니다.</p>
<p>아래에서는 Linux 환경과 Conda 및 Enroot를 활용한 가상환경 구축 방법에 대해 자세히 설명합니다. 자신의 프로젝트를 수행함에 있어, 필요한 가상환경을 적절히 <strong>선택</strong>하여 사용하세요.</p>
<ol type="1">
<li><p>Linux 환경 설정은 Linux 환경 자체에 대한 설정이 필요하신 분들이 사용하시면 됩니다.</p></li>
<li><p>Python 환경 설정은 Conda를 통해 Python 프로젝트를 위한 패키지를 관리할 필요가 있는 분들이 사용하시면 됩니다.</p></li>
<li><p>Enroot 환경 설정은 가상의 root권한(sudo 코드) 사용이 필요하신 분들이 사용하시면 됩니다.</p></li>
</ol>
<p>모든 환경 설정은 수행하실 필요가 없습니다. 본인에게 필요한 환경을 확인하신 후, <strong>필요한 환경만 설정하세요!</strong></p>
<section id="linux-환경-설정" class="level2 unnumbered">
<h2 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="linux-환경-설정">1. Linux 환경 설정</h2>
<p><strong>💡 Environment Modules</strong></p>
<pre><code>Environment Modules는 사용자로 하여금
Unix/Linux 환경 설정을 쉽게 수정할 수 있도록 돕는 모듈입니다.
Environment Modules를 활용하면 환경변수(PATH 등)을
일일히 다시 지정해 줄 필요가 없습니다.
공식 홈페이지(https://modules.sourceforge.net/)에서 다운로드 할 수 있습니다. </code></pre>
<section id="module-avail" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-avail">1.1 Module avail</h3>
<p>UBIA Cluster 내에서 사용 가능한 모든 모듈을 확인할 수 있는 명령어입니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb2"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb2-1"><a href="#cb2-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module avail</span>
<span id="cb2-2"><a href="#cb2-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb2-3"><a href="#cb2-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">----------------------</span> /opt/ohpc/pub/modulefiles <span class="at">----------------------</span></span>
<span id="cb2-4"><a href="#cb2-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">CUDA/11.2.2</span> cmake/3.24.2 cuda/11.2.2 </span>
<span id="cb2-5"><a href="#cb2-5" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">EasyBuild/4.9.1</span> compiler-rt/latest cuda/11.3.1 </span>
<span id="cb2-6"><a href="#cb2-6" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">R/4.3.1</span> compiler-rt/2023.1.0 <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">cuda/11.4.4</span> </span>
<span id="cb2-7"><a href="#cb2-7" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">advisor/latest</span> compiler-rt32/latest cuda/11.5.2 </span>
<span id="cb2-8"><a href="#cb2-8" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">advisor/2023.1.0</span> <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">compiler-rt32/2023.1.0</span> <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">cuda/11.6.2</span> </span>
<span id="cb2-9"><a href="#cb2-9" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">autotools</span> compiler/latest cuda/11.7.1 </span>
<span id="cb2-10"><a href="#cb2-10" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">ccl/latest</span> compiler/2023.1.0 <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">cuda/11.8.0</span> </span>
<span id="cb2-11"><a href="#cb2-11" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">ccl/2021.9.0</span> <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">compiler32/latest</span> cuda/12.0.0 </span>
<span id="cb2-12"><a href="#cb2-12" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">clck/latest</span> compiler32/2023.1.0 <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">cuda/12.1.1</span> </span>
<span id="cb2-13"><a href="#cb2-13" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">clck/2021.7.3</span> <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">cuda/leejihun_cuda</span> cuda/12.2.1 <span class="er">(</span><span class="ex">D</span><span class="kw">)</span> </span>
<span id="cb2-14"><a href="#cb2-14" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb2-15"><a href="#cb2-15" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">Where:</span></span>
<span id="cb2-16"><a href="#cb2-16" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">D:</span> Default Module</span>
<span id="cb2-17"><a href="#cb2-17" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb2-18"><a href="#cb2-18" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">If</span> the avail list is too long consider trying:</span>
<span id="cb2-19"><a href="#cb2-19" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb2-20"><a href="#cb2-20" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="st">"module --default avail"</span> or <span class="st">"ml -d av"</span> to just list the default modules.</span>
<span id="cb2-21"><a href="#cb2-21" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="st">"module overview"</span> or <span class="st">"ml ov"</span> to display the number of modules for each name.</span>
<span id="cb2-22"><a href="#cb2-22" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb2-23"><a href="#cb2-23" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Use</span> <span class="st">"module spider"</span> to find all possible modules and extensions.</span>
<span id="cb2-24"><a href="#cb2-24" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Use</span> <span class="st">"module keyword key1 key2 ..."</span> to search for all possible modules matching any of the <span class="st">"keys"</span>.</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
</section>
<section id="module-show" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-show">1.2 Module show</h3>
<p>사용하고자 하는 모듈의 세부 정보를 확인할 수 있는 명령어입니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb3"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb3-1"><a href="#cb3-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module show cuda/11.2.2</span>
<span id="cb3-2"><a href="#cb3-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">------------------------------------------------</span></span>
<span id="cb3-3"><a href="#cb3-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">/opt/ohpc/pub/modulefiles/cuda/11.2.2:</span></span>
<span id="cb3-4"><a href="#cb3-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">------------------------------------------------</span></span>
<span id="cb3-5"><a href="#cb3-5" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">whatis</span><span class="er">(</span><span class="st">"Name: CUDA Collection"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-6"><a href="#cb3-6" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">whatis</span><span class="er">(</span><span class="st">"Version: 11.2.2"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-7"><a href="#cb3-7" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">whatis</span><span class="er">(</span><span class="st">"Category: cuda"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-8"><a href="#cb3-8" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">prepend_path</span><span class="er">(</span><span class="st">"PATH"</span><span class="ex">,</span><span class="st">"/opt/ohpc/pub/cuda/11.2.2/bin"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-9"><a href="#cb3-9" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">prepend_path</span><span class="er">(</span><span class="st">"INCLUDE"</span><span class="ex">,</span><span class="st">"/opt/ohpc/pub/cuda/11.2.2/include"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-10"><a href="#cb3-10" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">prepend_path</span><span class="er">(</span><span class="st">"LD_LIBRARY_PATH"</span><span class="ex">,</span><span class="st">"/opt/ohpc/pub/cuda/11.2.2/lib64"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-11"><a href="#cb3-11" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">family</span><span class="er">(</span><span class="st">"cuda"</span><span class="kw">)</span></span>
<span id="cb3-12"><a href="#cb3-12" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">help</span><span class="er">(</span><span class="kw">[[</span> </span>
<span id="cb3-13"><a href="#cb3-13" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a>This module loads <span class="er">the</span> <span class="ex">CUDA</span></span>
<span id="cb3-14"><a href="#cb3-14" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb3-15"><a href="#cb3-15" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Version</span> 11.2.2</span>
<span id="cb3-16"><a href="#cb3-16" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb3-17"><a href="#cb3-17" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">]]</span><span class="kw">)</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
</section>
<section id="module-load" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-load">1.3 Module load</h3>
<p>특정 모듈을 불러와 사용할 수 있는 명령어입니다. 여러 모듈을 동시에 불러올 수도 있습니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb4"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb4-1"><a href="#cb4-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module load cuda/11.2.2</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
</section>
<section id="module-list" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-list">1.4 Module list</h3>
<p>현재 사용 중인 모듈의 목록을 확인할 수 있는 명령어입니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb5"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb5-1"><a href="#cb5-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module list</span>
<span id="cb5-2"><a href="#cb5-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb5-3"><a href="#cb5-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Currently</span> Loaded Modules:</span>
<span id="cb5-4"><a href="#cb5-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="ex">1</span><span class="er">)</span> <span class="ex">cuda/11.2.2</span> 2<span class="er">)</span> <span class="ex">dal/latest</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
</section>
<section id="module-rm" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-rm">1.5 Module rm</h3>
<p>사용 목록에서 특정 모듈을 제거할 때 사용하는 명령어입니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb6"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb6-1"><a href="#cb6-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module rm dal/latest</span>
<span id="cb6-2"><a href="#cb6-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb6-3"><a href="#cb6-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Removing</span> dal version 2023.1.0</span>
<span id="cb6-4"><a href="#cb6-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">Use</span> <span class="kw">`</span><span class="ex">module</span> list<span class="kw">`</span> to view any remaining dependent modules.</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
</section>
<section id="module-purge" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="module-purge">1.6 Module purge</h3>
<p><code>module rm</code>와 달리 전체 사용 목록을 초기화하기 위해 사용하는 명령어입니다. <code>module purge</code>실행 후 <code>module list</code>에 아무런 module이 출력되지 않는 것을 확인할 수 있습니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb7"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb7-1"><a href="#cb7-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module purge</span>
<span id="cb7-2"><a href="#cb7-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb7-3"><a href="#cb7-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="kw">(</span><span class="ex">ubai</span><span class="kw">)</span> <span class="ex">[ssu@gate1</span> ~]$ module list</span>
<span id="cb7-4"><a href="#cb7-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">No</span> modules loaded</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p><br></p>
</section>
</section>
<section id="python-환경-설정" class="level2 unnumbered">
<h2 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="python-환경-설정">2. Python 환경 설정</h2>
<p><strong>💡 Python</strong></p>
<pre><code>Python은 웹 어플리케이션, 소프트웨어 개발, 데이터 사이언스,
머신러닝, 딥러닝에 널리 사용되는 프로그래밍 언어입니다.
오픈소스 환경을 가지고 있으며, 많은 사람들이 이용하는 언어입니다.</code></pre>
<p>파이썬을 활용하기 위해서는 보통 Anaconda를 활용하지만 리눅스 컴퓨팅 환경에서는 Miniconda를 활용합니다. UBAI 슈퍼컴퓨터에서도 파이썬을 이용하기 위해서는 Miniconda를 사용해야 합니다.</p>
<p><strong>💡 Miniconda</strong></p>
<pre><code>Anaconda는 머신러닝이나 데이터 분석 등에 사용하는
여러가지 패키지가 기본적으로 포함되어있는 파이썬 배포판입니다.
파이썬의 가상환경을 구축하는데 매우 유용하게 사용됩니다.
Miniconda는 Anaconda의 경량버전이라고 볼 수 있습니다.</code></pre>
<section id="minicoda-설치" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="minicoda-설치">2.1 Minicoda 설치</h3>
<p>Miniconda 설치를 진행하기 위해서는 Miniconda의 다운로드 사이트 링크를 이용한 다운로드 방법을 채택합니다.</p>
<ol type="1">
<li><p>메뉴에서 새 terminal을 생성하시고 terminal 칸에 아래의 명령어를 입력합니다. 이는 Miniconda 다운로드 파일 인터넷으로부터 다운로드하는 과정입니다.</p>
<p><code>wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh</code></p></li>
<li><p>wget으로 받은 파일을 이용해 bash 명령어를 통해서 설치를 진행합니다.</p>
<p><code>bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh</code></p></li>
<li><p>실행하면 Miniconda 사용에 따른 안내문과 같은 내용이 뜨기 때문에 내용이 꽤 깁니다. 라이센스 동의에 대한 내용이 모두 나타날 때까지 Enter를 꾹 눌러줍니다. 그 후 라이센스 동의 확인에 대한 질문에 ‘yes’ 라고 입력해줍니다. Enter를 너무 오래 눌러 동의 화면이 바로 넘어가지 않게 주의하세요.</p></li>
<li><p>화면에서 해당 경로가 자신의 서버에 있는 경로와 맞는지 확인 후 Enter를 눌러줍니다.</p></li>
<li><p>처음 접속 시, conda init 진행 선택에 대한 질문이 뜹니다. ’yes’를 입력하신 후 enter를 눌러주시면 됩니다.</p></li>
<li><p>변경사항 반영을 위해 지금 작업한 창을 닫고 새로 접속하세요.</p></li>
<li><p>재접속 시, terminal에 <code>(base)[사용자ID@사용자_gate_number]</code>가 보인다면 성공적으로 설치가 완료된 것입니다. 설치 후 왼쪽의 탐색기(Explorer) 목록에 miniconda 폴더가 있는지 꼭 확인해주세요.</p></li>
</ol>
</section>
<section id="minicoda-실행" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="minicoda-실행">2.2 Minicoda 실행</h3>
<p>Miniconda 설치 후, Python 가상 환경을 생성하여 실행합니다.</p>
<p>가상환경을 생성하여 사용하면 Python 패키지의 호환성 문제(Package Dependencies)를 해결하기 좋습니다. 여러 프로젝트나 공모전을 진행함에 있어 각 작업에 필요한 Python 패키지를 환경 별로 설치하여 따로 관리하기에 용이합니다.</p>
<ol type="1">
<li>가상 환경 생성을 위해 아래의 명령어를 terminal에 입력합니다.</li>
</ol>
<p><code>conda create -n {가상환경_이름} python={설치할_Python_버전}</code></p>
<p>ex. <code>conda create -n ubai python=3.11</code></p>
<ol start="2" type="1">
<li>생성한 가상환경에 진입합니다.</li>
</ol>
<p><code>conda activate {가상환경_이름}</code></p>
<p>ex. <code>conda activate ubai</code></p>
<p><img src="./jpg/conda.jpg" class="img-fluid"></p>
<p>최초 한 번만 가상환경을 만들어두면, 이후에는 해당 가상환경에 <code>conda activate</code>를 통해 바로 접근할 수 있습니다.</p>
<p>또한 <code>conda info --envs</code>를 통해 이미 생성되어있는 가상환경의 리스트를 확인할 수도 있으니, 참고 바랍니다.</p>
<p><br></p>
<p><strong>📌 참고 사항</strong></p>
<p>해당 가상 환경에서 Jupyter notebook의 사용을 희망할 시, 아래의 명령어를 입력하세요.<br> <code>pip install ipykernel jupyerlab</code> or <code>conda install ipykernel jupyterlab</code></p>
<div style="font-size: 13px;">
※ <em>Python 환경에서는 패키지 설치를 위해 <code>pip install</code> 명령어를 이용합니다.</em>
</div>
<p><br></p>
</section>
</section>
<section id="enroot" class="level2 unnumbered">
<h2 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot">3. Enroot</h2>
<p>enroot는 evidia에서 개발한 경량화된 컨테이너 런타임으로, 복잡한 컨테이너 관리 없이 간단하게 컨테이너를 실행할 수 있게 도와줍니다.</p>
<p>주로 연구 환경에서 패키지 호환이 되지 않는, 일명 ’소프트웨어 종속성 문제’를 해결하고, 필요한 작업을 root 권한으로 수행할 수 있는 안전한 환경을 제공합니다.</p>
<p>NVIDIA가 제공하는 <a href="https://github.com/NVIDIA/enroot">공식 문서</a>에서 enroot의 자세한 설명을 확인할 수 있습니다.</p>
<p><br></p>
<p>💡 현재 UBAI 슈퍼컴퓨터는 Rocky Linux 8.8 버전을 사용하고 있습니다.</p>
<p>이러한 환경에서 발생할 수 있는 문제점은 두 가지가 있습니다.</p>
<p>첫째, <code>/home</code> 경로 안에서 다양한 사용자들이 함께 사용하고 있기 때문에 <code>/home</code> 경로의 외적인 부분에 영향을 미칠 수 있는 권한인 root 권한을 부여하기 어려운 점이 있습니다. 이에 따라, sudo 접근이 불가능합니다.</p>
<p>둘째, Rocky Linux는 <code>dnf</code>라는 패키지 매니저를 사용하는데, 해당 패키지 매니저가 가지고 있지 않는 패키지들이 있습니다. <code>dnf search 패키지명</code> 명령어를 통해서 dnf라는 패키지 매니저가 설치해줄 수 있는 패키지들을 확인할 수 있는데요, 이 때 패키지를 찾을 수 없는 경우에는 다른 운영 체제를 사용해야 합니다.</p>
<p>이 경우 원하는 패키지를 설치하는 레퍼런스를 찾아보면, 일반적으로 Rocky Linux가 아닌 대중적인 리눅스 환경을 사용할 것입니다. 대표적인 예로, ubuntu나 centos를 들 수 있습니다.</p>
<p>따라서 여기서는 ubuntu OS를 설정하는 방법을 알아보겠습니다.</p>
<section id="enroot-컨테이너-기능" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-컨테이너-기능">3.1 Enroot 컨테이너 기능</h3>
<p>우리 클러스터는 사용자에게 <code>enroot</code> 명령어를 제공하고 있습니다. 이를 통해 시스템 소프트웨어 및 운영체제 종속적인 작업을 root 권한으로 안전하게 수행할 수 있도록 합니다. 클러스터의 확장을 통해서 2TB의 로컬 스토리지가 추가되었고, 이를 enroot 용으로 사용하게 되었습니다(각 노드의 /enroot에 데이터 위치).</p>
<p>참고로 enroot 명령어는 계산 노드에서만 수행 가능하기 때문에, 반드시 srun을 통해서 노드 내에서 실행시켜야 합니다! <em>(사용자들이 기본적으로 진입하는 포인트인 gate1과 gate2 안에서 가상 환경을 실행시키면 안됩니다.)</em> 이 때, 노드 사용 상황에 따라 시간이 다소 소요될 수 있습니다. 바로 진입이 되지 않는 것은 오류가 아닙니다.</p>
<p>따라서 gate에서부터 직접 노드들에 접속하여 가상 환경을 만들어야 합니다.</p>
<p>이러한 노드의 접근을 돕는 명령어가 <code>srun</code>입니다. enroot는 docker 환경을 기반으로 컨테이너 가상화를 돕는 명령어입니다. 기존의 Rocky linux 8.8 버전에서 활용하기 어려운 작업들이나, <code>sudo</code> 권한이 필요한 경우 가상환경 내에서 <code>sudo</code> 명령어 관련을 쓸 수 있습니다.</p>
</section>
<section id="image와-container" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="image와-container">3.2 Image와 Container</h3>
<p>이러한 enroot는 docker 환경에서의 image와 container 기반으로 이루어져있습니다.</p>
<p>docker는 가상 환경을 만드는 데 큰 도움을 주는 소프트웨어이며, enroot는 docker와 비슷한 환경을 조성하여, docker 기반의 image나 container을 실행시킬 수 있도록 도와줍니다.</p>
<p><br></p>
<p><strong>💡 Image</strong></p>
<pre><code>`image`는 어떤 실행 환경을 템플릿의 형태로 만들어 둔 것입니다.
컨테이너는 이미지에 쓰여있는 대로 환경이 구성되게 됩니다.
예를 들어, ubuntu 운영체제와 함께 파이썬 라이브러리들이 설치되어있는 환경을 이미지로 만들었다면,
나중에 이 이미지를 실행시키면,
ubuntu 운영체제와 다양한 파이썬 라이브러리들이 사전에 설치되어 있는 가상환경이 생겨
보다 쉽고 빠르게 작업을 할 수 있게 되는 것입니다.
image들이 모아져있는 dockerhub을 찾아보면
다양한 소프트웨어들이 이미지의 형태로 제공되고 있다는 것을 알 수 있습니다.</code></pre>
<p><br></p>
<p><strong>💡 Container</strong></p>
<pre><code>`container`는 이러한 이미지를 실행시켜 만든 가상 환경입니다.
컨테이너 환경은 이미지에 쓰여있던 대로 모든 세팅 절차를 거쳐 실행 환경을 구성한 것입니다.
이 때 사용자는 명령어를 통해 가상 환경에 진입할 수 있으며,
가상 환경 내에서는 모든 파일을 마음대로 조작할 수 있는 `root` 권한을 얻을 수 있게 됩니다.</code></pre>
<p><br></p>
</section>
<section id="enroot-가상환경-실행" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-가상환경-실행">3.3 Enroot 가상환경 실행</h3>
<section id="계산-노드-진입" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="계산-노드-진입">(1) 계산 노드 진입</h4>
<p>sbatch 명령어와는 다르게 enroot 명령어는 slurm에 의해 특별히 스케줄링 되는 명령어가 아닙니다.</p>
<p>따라서 직접 계산 노드에 진입하여, 그 노드 위에서 Linux의 작업처럼 진행해야 합니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb12"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb12-1"><a href="#cb12-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co"># gpu5 파티션 노드에 진입</span></span>
<span id="cb12-2"><a href="#cb12-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">srun</span> <span class="at">--pty</span> <span class="at">-p</span> gpu5 <span class="at">-c</span> 2 /bin/bash</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p><img src="./jpg/enroot_1.jpg" class="img-fluid"></p>
</section>
<section id="enroot-이미지-다운로드" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-이미지-다운로드">(2) Enroot 이미지 다운로드</h4>
<p>프로젝트 수행을 위해 필요한 이미지를 <a href="https://hub.docker.com/">docker hub</a>에서 다운로드할 수 있습니다.</p>
<p><img src="./jpg/dockerhub.jpg" class="img-fluid"></p>
<p>docker hub에서 이미지를 다운 받을 때에는 꼭 <code>docker://</code> 접두사를 붙여야 합니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb13"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb13-1"><a href="#cb13-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co"># dockerhub에서 원하는 이미지를 다운로드</span></span>
<span id="cb13-2"><a href="#cb13-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">enroot</span> import docker://eclipse/ubuntu_python</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p><img src="./jpg/enroot_2.jpg" class="img-fluid"></p>
</section>
<section id="enroot-이미지-실행-및-컨테이너-생성" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-이미지-실행-및-컨테이너-생성">(3) Enroot 이미지 실행 및 컨테이너 생성</h4>
<p>변환된 이미지를 <code>enroot</code>에서 사용할 수 있도록 생성하고 실행합니다.</p>
<p>이를 통해 enroot 컨테이너를 생성합니다.</p>
<p>이미지를 다운로드하고, 파일을 살펴보면 <code>ubuntu.sqsh</code>와 같은 확장자를 가진 이미지가 생깁니다.</p>
<p>아래의 명령어를 통해 이미지로 가상환경을 세팅할 수 있습니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb14"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb14-1"><a href="#cb14-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co"># 다운로드된 이미지 ubuntu.sqsh를 컨테이너로 만듦</span></span>
<span id="cb14-2"><a href="#cb14-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">enroot</span> create <span class="at">-n</span> mycontainer eclipse_ubuntu_python.sqsh</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p><img src="./jpg/enroot_3.jpg" class="img-fluid"></p>
</section>
<section id="enroot-컨테이너-진입" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-컨테이너-진입">(4) Enroot 컨테이너 진입</h4>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb15"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb15-1"><a href="#cb15-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co"># 컨테이너 환경에 진입 (version.1)</span></span>
<span id="cb15-2"><a href="#cb15-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">enroot</span> start mycontainer</span>
<span id="cb15-3"><a href="#cb15-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co"># 컨테이너 환경에 진입 (version.2)</span></span>
<span id="cb15-4"><a href="#cb15-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">enroot</span> start <span class="at">--root</span> <span class="at">--rw</span> <span class="at">--mount</span> .:/mnt ubuntu-test /bin/bash</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p>여기서 주목할 점은 <code>--mount .:/mnt</code> 명령을 통해 호스트에 있는 디렉터리를 컨테이너에 특정 디렉터리로 마운트할 수 있다는 점입니다.</p>
<p>따라서 mnt 디렉토리에 들어가시면 원래 본인의 home 디렉터리에 있는 파일들이 그대로 있는 것을 확인할 수 있습니다.</p>
</section>
<section id="enroot-이미지-저장" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-이미지-저장">(5) Enroot 이미지 저장</h4>
<p>enroot에서는 기본적으로 컨테이너의 상태가 유지되지 않기 때문에, 작업한 환경을 다시 실행할 수 있도록 하려면 환경을 이미지로 만들어 두는 과정이 필요합니다.</p>
<p>enroot에서는 생성한 컨테이너 내에서 설정이나 파일 등을 추가해도 해당 내용이 지속되지 않습니다.</p>
<p>그래서 생성한 컨테이너 환경을 저장해 나중에 재사용하고 싶다면 변경한 환경을 새로운 이미지로 저장해야 합니다.</p>
<p>기존 컨테이너에서 작업을 마친 후, 환경 구축 상에서 변화가 있다면 다음과 같이 별도의 이미지로 저장할 수 있습니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb16"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb16-1"><a href="#cb16-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">enroot</span> export mycontainer new_image.sqsh</span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p>이미지가 생성되면, 이 이미지를 기반으로 컨테이너를 새로 만들고 실행할 수 있습니다.</p>
<p>이 과정으로 수정된 환경을 영구적으로 유지할 수 있으며, 나중에 해당 이미지를 기반으로 원하는 작업을 이어나갈 수 있습니다.</p>
</section>
<section id="enroot-컨테이너-종료" class="level4 unnumbered">
<h4 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="enroot-컨테이너-종료">(6) Enroot 컨테이너 종료</h4>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb17"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb17-1"><a href="#cb17-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">exit</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p><code>exit</code> 외에도 <code>Ctrl+D</code>를 눌러서도 빠져나올 수 있습니다.</p>
</section>
</section>
</section>
</main> <!-- /main -->
<script id="quarto-html-after-body" type="application/javascript">
window.document.addEventListener("DOMContentLoaded", function (event) {
const toggleBodyColorMode = (bsSheetEl) => {
const mode = bsSheetEl.getAttribute("data-mode");
const bodyEl = window.document.querySelector("body");
if (mode === "dark") {
bodyEl.classList.add("quarto-dark");
bodyEl.classList.remove("quarto-light");
} else {
bodyEl.classList.add("quarto-light");
bodyEl.classList.remove("quarto-dark");
}
}
const toggleBodyColorPrimary = () => {
const bsSheetEl = window.document.querySelector("link#quarto-bootstrap");
if (bsSheetEl) {
toggleBodyColorMode(bsSheetEl);
}
}
toggleBodyColorPrimary();
const icon = "";
const anchorJS = new window.AnchorJS();
anchorJS.options = {
placement: 'right',
icon: icon
};
anchorJS.add('.anchored');
const isCodeAnnotation = (el) => {
for (const clz of el.classList) {
if (clz.startsWith('code-annotation-')) {
return true;
}
}
return false;
}
const onCopySuccess = function(e) {
// button target
const button = e.trigger;
// don't keep focus
button.blur();
// flash "checked"
button.classList.add('code-copy-button-checked');
var currentTitle = button.getAttribute("title");
button.setAttribute("title", "Copied!");
let tooltip;
if (window.bootstrap) {
button.setAttribute("data-bs-toggle", "tooltip");
button.setAttribute("data-bs-placement", "left");
button.setAttribute("data-bs-title", "Copied!");
tooltip = new bootstrap.Tooltip(button,
{ trigger: "manual",
customClass: "code-copy-button-tooltip",
offset: [0, -8]});
tooltip.show();
}
setTimeout(function() {
if (tooltip) {
tooltip.hide();
button.removeAttribute("data-bs-title");
button.removeAttribute("data-bs-toggle");
button.removeAttribute("data-bs-placement");
}
button.setAttribute("title", currentTitle);
button.classList.remove('code-copy-button-checked');
}, 1000);
// clear code selection
e.clearSelection();
}
const getTextToCopy = function(trigger) {
const codeEl = trigger.previousElementSibling.cloneNode(true);
for (const childEl of codeEl.children) {
if (isCodeAnnotation(childEl)) {
childEl.remove();
}
}
return codeEl.innerText;
}
const clipboard = new window.ClipboardJS('.code-copy-button:not([data-in-quarto-modal])', {
text: getTextToCopy
});
clipboard.on('success', onCopySuccess);
if (window.document.getElementById('quarto-embedded-source-code-modal')) {
// For code content inside modals, clipBoardJS needs to be initialized with a container option
// TODO: Check when it could be a function (https://github.com/zenorocha/clipboard.js/issues/860)
const clipboardModal = new window.ClipboardJS('.code-copy-button[data-in-quarto-modal]', {
text: getTextToCopy,
container: window.document.getElementById('quarto-embedded-source-code-modal')
});
clipboardModal.on('success', onCopySuccess);
}
var localhostRegex = new RegExp(/^(?:http|https):\/\/localhost\:?[0-9]*\//);
var mailtoRegex = new RegExp(/^mailto:/);
var filterRegex = new RegExp('/' + window.location.host + '/');
var isInternal = (href) => {
return filterRegex.test(href) || localhostRegex.test(href) || mailtoRegex.test(href);
}
// Inspect non-navigation links and adorn them if external
var links = window.document.querySelectorAll('a[href]:not(.nav-link):not(.navbar-brand):not(.toc-action):not(.sidebar-link):not(.sidebar-item-toggle):not(.pagination-link):not(.no-external):not([aria-hidden]):not(.dropdown-item):not(.quarto-navigation-tool):not(.about-link)');
for (var i=0; i<links.length; i++) {
const link = links[i];
if (!isInternal(link.href)) {
// undo the damage that might have been done by quarto-nav.js in the case of
// links that we want to consider external
if (link.dataset.originalHref !== undefined) {
link.href = link.dataset.originalHref;
}
}
}
function tippyHover(el, contentFn, onTriggerFn, onUntriggerFn) {
const config = {
allowHTML: true,
maxWidth: 500,
delay: 100,
arrow: false,
appendTo: function(el) {
return el.parentElement;
},
interactive: true,
interactiveBorder: 10,
theme: 'quarto',
placement: 'bottom-start',
};
if (contentFn) {
config.content = contentFn;
}
if (onTriggerFn) {
config.onTrigger = onTriggerFn;
}
if (onUntriggerFn) {
config.onUntrigger = onUntriggerFn;
}
window.tippy(el, config);
}
const noterefs = window.document.querySelectorAll('a[role="doc-noteref"]');
for (var i=0; i<noterefs.length; i++) {
const ref = noterefs[i];
tippyHover(ref, function() {
// use id or data attribute instead here
let href = ref.getAttribute('data-footnote-href') || ref.getAttribute('href');
try { href = new URL(href).hash; } catch {}
const id = href.replace(/^#\/?/, "");
const note = window.document.getElementById(id);
if (note) {
return note.innerHTML;
} else {
return "";
}
});
}
const xrefs = window.document.querySelectorAll('a.quarto-xref');
const processXRef = (id, note) => {
// Strip column container classes
const stripColumnClz = (el) => {
el.classList.remove("page-full", "page-columns");
if (el.children) {
for (const child of el.children) {
stripColumnClz(child);
}
}
}
stripColumnClz(note)
if (id === null || id.startsWith('sec-')) {
// Special case sections, only their first couple elements
const container = document.createElement("div");
if (note.children && note.children.length > 2) {
container.appendChild(note.children[0].cloneNode(true));
for (let i = 1; i < note.children.length; i++) {
const child = note.children[i];
if (child.tagName === "P" && child.innerText === "") {
continue;
} else {
container.appendChild(child.cloneNode(true));
break;
}
}
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(container);
}
return container.innerHTML
} else {
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(note);
}
return note.innerHTML;
}
} else {
// Remove any anchor links if they are present
const anchorLink = note.querySelector('a.anchorjs-link');
if (anchorLink) {
anchorLink.remove();
}
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(note);
}
// TODO in 1.5, we should make sure this works without a callout special case
if (note.classList.contains("callout")) {
return note.outerHTML;
} else {
return note.innerHTML;
}
}
}
for (var i=0; i<xrefs.length; i++) {
const xref = xrefs[i];
tippyHover(xref, undefined, function(instance) {
instance.disable();
let url = xref.getAttribute('href');
let hash = undefined;
if (url.startsWith('#')) {
hash = url;
} else {
try { hash = new URL(url).hash; } catch {}
}
if (hash) {
const id = hash.replace(/^#\/?/, "");
const note = window.document.getElementById(id);
if (note !== null) {
try {
const html = processXRef(id, note.cloneNode(true));
instance.setContent(html);
} finally {
instance.enable();
instance.show();
}
} else {
// See if we can fetch this
fetch(url.split('#')[0])
.then(res => res.text())
.then(html => {
const parser = new DOMParser();
const htmlDoc = parser.parseFromString(html, "text/html");
const note = htmlDoc.getElementById(id);
if (note !== null) {
const html = processXRef(id, note);
instance.setContent(html);
}
}).finally(() => {
instance.enable();
instance.show();
});
}
} else {
// See if we can fetch a full url (with no hash to target)
// This is a special case and we should probably do some content thinning / targeting
fetch(url)
.then(res => res.text())
.then(html => {
const parser = new DOMParser();
const htmlDoc = parser.parseFromString(html, "text/html");
const note = htmlDoc.querySelector('main.content');
if (note !== null) {
// This should only happen for chapter cross references
// (since there is no id in the URL)
// remove the first header
if (note.children.length > 0 && note.children[0].tagName === "HEADER") {
note.children[0].remove();
}
const html = processXRef(null, note);
instance.setContent(html);
}
}).finally(() => {
instance.enable();
instance.show();
});
}
}, function(instance) {
});
}
let selectedAnnoteEl;
const selectorForAnnotation = ( cell, annotation) => {
let cellAttr = 'data-code-cell="' + cell + '"';
let lineAttr = 'data-code-annotation="' + annotation + '"';
const selector = 'span[' + cellAttr + '][' + lineAttr + ']';
return selector;
}
const selectCodeLines = (annoteEl) => {
const doc = window.document;
const targetCell = annoteEl.getAttribute("data-target-cell");
const targetAnnotation = annoteEl.getAttribute("data-target-annotation");
const annoteSpan = window.document.querySelector(selectorForAnnotation(targetCell, targetAnnotation));
const lines = annoteSpan.getAttribute("data-code-lines").split(",");
const lineIds = lines.map((line) => {
return targetCell + "-" + line;
})
let top = null;
let height = null;
let parent = null;
if (lineIds.length > 0) {
//compute the position of the single el (top and bottom and make a div)
const el = window.document.getElementById(lineIds[0]);
top = el.offsetTop;
height = el.offsetHeight;
parent = el.parentElement.parentElement;
if (lineIds.length > 1) {
const lastEl = window.document.getElementById(lineIds[lineIds.length - 1]);
const bottom = lastEl.offsetTop + lastEl.offsetHeight;
height = bottom - top;
}
if (top !== null && height !== null && parent !== null) {
// cook up a div (if necessary) and position it
let div = window.document.getElementById("code-annotation-line-highlight");
if (div === null) {
div = window.document.createElement("div");
div.setAttribute("id", "code-annotation-line-highlight");
div.style.position = 'absolute';
parent.appendChild(div);
}
div.style.top = top - 2 + "px";
div.style.height = height + 4 + "px";
div.style.left = 0;
let gutterDiv = window.document.getElementById("code-annotation-line-highlight-gutter");
if (gutterDiv === null) {
gutterDiv = window.document.createElement("div");
gutterDiv.setAttribute("id", "code-annotation-line-highlight-gutter");
gutterDiv.style.position = 'absolute';
const codeCell = window.document.getElementById(targetCell);
const gutter = codeCell.querySelector('.code-annotation-gutter');
gutter.appendChild(gutterDiv);
}
gutterDiv.style.top = top - 2 + "px";
gutterDiv.style.height = height + 4 + "px";
}
selectedAnnoteEl = annoteEl;
}
};
const unselectCodeLines = () => {
const elementsIds = ["code-annotation-line-highlight", "code-annotation-line-highlight-gutter"];
elementsIds.forEach((elId) => {
const div = window.document.getElementById(elId);
if (div) {
div.remove();
}
});
selectedAnnoteEl = undefined;
};
// Handle positioning of the toggle
window.addEventListener(
"resize",
throttle(() => {
elRect = undefined;
if (selectedAnnoteEl) {
selectCodeLines(selectedAnnoteEl);
}
}, 10)
);
function throttle(fn, ms) {
let throttle = false;
let timer;
return (...args) => {
if(!throttle) { // first call gets through
fn.apply(this, args);
throttle = true;
} else { // all the others get throttled
if(timer) clearTimeout(timer); // cancel #2
timer = setTimeout(() => {
fn.apply(this, args);
timer = throttle = false;
}, ms);
}
};
}
// Attach click handler to the DT
const annoteDls = window.document.querySelectorAll('dt[data-target-cell]');
for (const annoteDlNode of annoteDls) {
annoteDlNode.addEventListener('click', (event) => {
const clickedEl = event.target;
if (clickedEl !== selectedAnnoteEl) {
unselectCodeLines();
const activeEl = window.document.querySelector('dt[data-target-cell].code-annotation-active');
if (activeEl) {
activeEl.classList.remove('code-annotation-active');
}
selectCodeLines(clickedEl);
clickedEl.classList.add('code-annotation-active');
} else {
// Unselect the line
unselectCodeLines();
clickedEl.classList.remove('code-annotation-active');
}
});
}
const findCites = (el) => {
const parentEl = el.parentElement;
if (parentEl) {
const cites = parentEl.dataset.cites;
if (cites) {
return {
el,
cites: cites.split(' ')
};
} else {
return findCites(el.parentElement)
}
} else {
return undefined;
}
};
var bibliorefs = window.document.querySelectorAll('a[role="doc-biblioref"]');
for (var i=0; i<bibliorefs.length; i++) {
const ref = bibliorefs[i];
const citeInfo = findCites(ref);
if (citeInfo) {
tippyHover(citeInfo.el, function() {
var popup = window.document.createElement('div');
citeInfo.cites.forEach(function(cite) {
var citeDiv = window.document.createElement('div');
citeDiv.classList.add('hanging-indent');
citeDiv.classList.add('csl-entry');
var biblioDiv = window.document.getElementById('ref-' + cite);
if (biblioDiv) {
citeDiv.innerHTML = biblioDiv.innerHTML;
}
popup.appendChild(citeDiv);
});
return popup.innerHTML;
});
}
}
});
</script>
<nav class="page-navigation">
<div class="nav-page nav-page-previous">
<a href="./접속 방법.html" class="pagination-link" aria-label="Chapter2. 접속 방법">
<i class="bi bi-arrow-left-short"></i> <span class="nav-page-text"><span class="chapter-title">Chapter2. 접속 방법</span></span>
</a>
</div>
<div class="nav-page nav-page-next">
<a href="./Python 실행.html" class="pagination-link" aria-label="Chapter4. Python 실행">
<span class="nav-page-text"><span class="chapter-title">Chapter4. Python 실행</span></span> <i class="bi bi-arrow-right-short"></i>
</a>
</div>
</nav>
</div> <!-- /content -->
<footer class="footer">
<div class="nav-footer">
<div class="nav-footer-left">
<p>Urban Big Data and AI Institution</p>
</div>
<div class="nav-footer-center">
</div>
<div class="nav-footer-right">
<p>University of Seoul</p>
</div>
</div>
</footer>
</body></html>