Skip to content

Commit c971c32

Browse files
WirkungstrefferWirkungstreffer
authored
Lead field matrix (#249)
* add AAL2 atlas data files * add lead-field matrix function script
1 parent ec2434e commit c971c32

File tree

3 files changed

+750
-0
lines changed

3 files changed

+750
-0
lines changed

‎examples/data/AAL2_atlas_data/AAL2.nii

1.72 MB
Binary file not shown.

‎examples/data/AAL2_atlas_data/AAL2.xml

Lines changed: 137 additions & 0 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -0,0 +1,137 @@
1+
<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
2+
<atlas version="2.0">
3+
<header>
4+
<name>aal2</name>
5+
<version>1.0</version>
6+
<description>ROI_MNI_V5</description>
7+
<url></url>
8+
<licence></licence>
9+
<coordinate_system>MNI</coordinate_system>
10+
<type>Label</type>
11+
<images>
12+
<imagefile>AAL2.nii</imagefile>
13+
</images>
14+
</header>
15+
<data>
16+
<label><index>2001</index><name>Precentral_L</name></label>
17+
<label><index>2002</index><name>Precentral_R</name></label>
18+
<label><index>2101</index><name>Frontal_Sup_2_L</name></label>
19+
<label><index>2102</index><name>Frontal_Sup_2_R</name></label>
20+
<label><index>2201</index><name>Frontal_Mid_2_L</name></label>
21+
<label><index>2202</index><name>Frontal_Mid_2_R</name></label>
22+
<label><index>2301</index><name>Frontal_Inf_Oper_L</name></label>
23+
<label><index>2302</index><name>Frontal_Inf_Oper_R</name></label>
24+
<label><index>2311</index><name>Frontal_Inf_Tri_L</name></label>
25+
<label><index>2312</index><name>Frontal_Inf_Tri_R</name></label>
26+
<label><index>2321</index><name>Frontal_Inf_Orb_2_L</name></label>
27+
<label><index>2322</index><name>Frontal_Inf_Orb_2_R</name></label>
28+
<label><index>2331</index><name>Rolandic_Oper_L</name></label>
29+
<label><index>2332</index><name>Rolandic_Oper_R</name></label>
30+
<label><index>2401</index><name>Supp_Motor_Area_L</name></label>
31+
<label><index>2402</index><name>Supp_Motor_Area_R</name></label>
32+
<label><index>2501</index><name>Olfactory_L</name></label>
33+
<label><index>2502</index><name>Olfactory_R</name></label>
34+
<label><index>2601</index><name>Frontal_Sup_Medial_L</name></label>
35+
<label><index>2602</index><name>Frontal_Sup_Medial_R</name></label>
36+
<label><index>2611</index><name>Frontal_Med_Orb_L</name></label>
37+
<label><index>2612</index><name>Frontal_Med_Orb_R</name></label>
38+
<label><index>2701</index><name>Rectus_L</name></label>
39+
<label><index>2702</index><name>Rectus_R</name></label>
40+
<label><index>2801</index><name>OFCmed_L</name></label>
41+
<label><index>2802</index><name>OFCmed_R</name></label>
42+
<label><index>2811</index><name>OFCant_L</name></label>
43+
<label><index>2812</index><name>OFCant_R</name></label>
44+
<label><index>2821</index><name>OFCpost_L</name></label>
45+
<label><index>2822</index><name>OFCpost_R</name></label>
46+
<label><index>2831</index><name>OFClat_L</name></label>
47+
<label><index>2832</index><name>OFClat_R</name></label>
48+
<label><index>3001</index><name>Insula_L</name></label>
49+
<label><index>3002</index><name>Insula_R</name></label>
50+
<label><index>4001</index><name>Cingulate_Ant_L</name></label>
51+
<label><index>4002</index><name>Cingulate_Ant_R</name></label>
52+
<label><index>4011</index><name>Cingulate_Mid_L</name></label>
53+
<label><index>4012</index><name>Cingulate_Mid_R</name></label>
54+
<label><index>4021</index><name>Cingulate_Post_L</name></label>
55+
<label><index>4022</index><name>Cingulate_Post_R</name></label>
56+
<label><index>4101</index><name>Hippocampus_L</name></label>
57+
<label><index>4102</index><name>Hippocampus_R</name></label>
58+
<label><index>4111</index><name>ParaHippocampal_L</name></label>
59+
<label><index>4112</index><name>ParaHippocampal_R</name></label>
60+
<label><index>4201</index><name>Amygdala_L</name></label>
61+
<label><index>4202</index><name>Amygdala_R</name></label>
62+
<label><index>5001</index><name>Calcarine_L</name></label>
63+
<label><index>5002</index><name>Calcarine_R</name></label>
64+
<label><index>5011</index><name>Cuneus_L</name></label>
65+
<label><index>5012</index><name>Cuneus_R</name></label>
66+
<label><index>5021</index><name>Lingual_L</name></label>
67+
<label><index>5022</index><name>Lingual_R</name></label>
68+
<label><index>5101</index><name>Occipital_Sup_L</name></label>
69+
<label><index>5102</index><name>Occipital_Sup_R</name></label>
70+
<label><index>5201</index><name>Occipital_Mid_L</name></label>
71+
<label><index>5202</index><name>Occipital_Mid_R</name></label>
72+
<label><index>5301</index><name>Occipital_Inf_L</name></label>
73+
<label><index>5302</index><name>Occipital_Inf_R</name></label>
74+
<label><index>5401</index><name>Fusiform_L</name></label>
75+
<label><index>5402</index><name>Fusiform_R</name></label>
76+
<label><index>6001</index><name>Postcentral_L</name></label>
77+
<label><index>6002</index><name>Postcentral_R</name></label>
78+
<label><index>6101</index><name>Parietal_Sup_L</name></label>
79+
<label><index>6102</index><name>Parietal_Sup_R</name></label>
80+
<label><index>6201</index><name>Parietal_Inf_L</name></label>
81+
<label><index>6202</index><name>Parietal_Inf_R</name></label>
82+
<label><index>6211</index><name>SupraMarginal_L</name></label>
83+
<label><index>6212</index><name>SupraMarginal_R</name></label>
84+
<label><index>6221</index><name>Angular_L</name></label>
85+
<label><index>6222</index><name>Angular_R</name></label>
86+
<label><index>6301</index><name>Precuneus_L</name></label>
87+
<label><index>6302</index><name>Precuneus_R</name></label>
88+
<label><index>6401</index><name>Paracentral_Lobule_L</name></label>
89+
<label><index>6402</index><name>Paracentral_Lobule_R</name></label>
90+
<label><index>7001</index><name>Caudate_L</name></label>
91+
<label><index>7002</index><name>Caudate_R</name></label>
92+
<label><index>7011</index><name>Putamen_L</name></label>
93+
<label><index>7012</index><name>Putamen_R</name></label>
94+
<label><index>7021</index><name>Pallidum_L</name></label>
95+
<label><index>7022</index><name>Pallidum_R</name></label>
96+
<label><index>7101</index><name>Thalamus_L</name></label>
97+
<label><index>7102</index><name>Thalamus_R</name></label>
98+
<label><index>8101</index><name>Heschl_L</name></label>
99+
<label><index>8102</index><name>Heschl_R</name></label>
100+
<label><index>8111</index><name>Temporal_Sup_L</name></label>
101+
<label><index>8112</index><name>Temporal_Sup_R</name></label>
102+
<label><index>8121</index><name>Temporal_Pole_Sup_L</name></label>
103+
<label><index>8122</index><name>Temporal_Pole_Sup_R</name></label>
104+
<label><index>8201</index><name>Temporal_Mid_L</name></label>
105+
<label><index>8202</index><name>Temporal_Mid_R</name></label>
106+
<label><index>8211</index><name>Temporal_Pole_Mid_L</name></label>
107+
<label><index>8212</index><name>Temporal_Pole_Mid_R</name></label>
108+
<label><index>8301</index><name>Temporal_Inf_L</name></label>
109+
<label><index>8302</index><name>Temporal_Inf_R</name></label>
110+
<label><index>9001</index><name>Cerebelum_Crus1_L</name></label>
111+
<label><index>9002</index><name>Cerebelum_Crus1_R</name></label>
112+
<label><index>9011</index><name>Cerebelum_Crus2_L</name></label>
113+
<label><index>9012</index><name>Cerebelum_Crus2_R</name></label>
114+
<label><index>9021</index><name>Cerebelum_3_L</name></label>
115+
<label><index>9022</index><name>Cerebelum_3_R</name></label>
116+
<label><index>9031</index><name>Cerebelum_4_5_L</name></label>
117+
<label><index>9032</index><name>Cerebelum_4_5_R</name></label>
118+
<label><index>9041</index><name>Cerebelum_6_L</name></label>
119+
<label><index>9042</index><name>Cerebelum_6_R</name></label>
120+
<label><index>9051</index><name>Cerebelum_7b_L</name></label>
121+
<label><index>9052</index><name>Cerebelum_7b_R</name></label>
122+
<label><index>9061</index><name>Cerebelum_8_L</name></label>
123+
<label><index>9062</index><name>Cerebelum_8_R</name></label>
124+
<label><index>9071</index><name>Cerebelum_9_L</name></label>
125+
<label><index>9072</index><name>Cerebelum_9_R</name></label>
126+
<label><index>9081</index><name>Cerebelum_10_L</name></label>
127+
<label><index>9082</index><name>Cerebelum_10_R</name></label>
128+
<label><index>9100</index><name>Vermis_1_2</name></label>
129+
<label><index>9110</index><name>Vermis_3</name></label>
130+
<label><index>9120</index><name>Vermis_4_5</name></label>
131+
<label><index>9130</index><name>Vermis_6</name></label>
132+
<label><index>9140</index><name>Vermis_7</name></label>
133+
<label><index>9150</index><name>Vermis_8</name></label>
134+
<label><index>9160</index><name>Vermis_9</name></label>
135+
<label><index>9170</index><name>Vermis_10</name></label>
136+
</data>
137+
</atlas>

0 commit comments

Comments
 (0)