Skip to content

Latest commit

 

History

History
440 lines (421 loc) · 18.5 KB

data_tree.md

File metadata and controls

440 lines (421 loc) · 18.5 KB

rt-me-fMRI dataset tree

Tree 1

rt-me-fMRI
.
├── README
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── task-emotionProcessingImagined_events.json
├── task-emotionProcessing_events.json
├── task-fingerTappingImagined_events.json
├── task-fingerTapping_events.json
├── sub-001
│   ├── anat
│   │   └── sub-001_T1w.nii
│   └── func
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_physio.json
│       └── sub-001_task-rest_run-2_physio.tsv.gz
├── sub-002
├── sub-003
├── sub-004
├── sub-005
├── sub-006
├── sub-007
├── sub-010
├── sub-011
├── sub-012
├── sub-013
├── sub-015
├── sub-016
├── sub-017
├── sub-018
├── sub-019
├── sub-020
├── sub-021
├── sub-022
├── sub-023
├── sub-024
├── sub-025
├── sub-026
├── sub-027
├── sub-029
├── sub-030
├── sub-031
├── sub-032
└── derivatives
    ├── fmrwhy-dash
    └── fmrwhy-qc
        ├── sub-001
        │   ├── anat
        │   ├── func
        │   └── report_[yyyymmddhhmmss]
        │       ├── assets
        │       ├── img
        │       └── sub-001_desc-QCreport_[yyyymmddhhmmss].html
        ├── sub-002
        :       :
        └── sub-032

Tree 2

rt-me-fMRI
.
├── README
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── task-emotionProcessingImagined_events.json
├── task-emotionProcessing_events.json
├── task-fingerTappingImagined_events.json
├── task-fingerTapping_events.json
├── sub-001
├── sub-002
├── sub-003
├── sub-004
├── sub-005
├── sub-006
├── sub-007
├── sub-010
├── sub-011
├── sub-012
├── sub-013
├── sub-015
├── sub-016
├── sub-017
├── sub-018
├── sub-019
├── sub-020
├── sub-021
├── sub-022
├── sub-023
├── sub-024
├── sub-025
├── sub-026
├── sub-027
├── sub-029
├── sub-030
├── sub-031
├── sub-032
└── derivatives

Tree 3

rt-me-fMRI
.
├── README
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── task-emotionProcessingImagined_events.json
├── task-emotionProcessing_events.json
├── task-fingerTappingImagined_events.json
├── task-fingerTapping_events.json
├── sub-001
│   ├── anat
│   │   └── sub-001_T1w.nii
│   └── func
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_physio.json
│       └── sub-001_task-rest_run-2_physio.tsv.gz
├── sub-002
:       :
├── sub-032
└── derivatives

Tree 4

rt-me-fMRI
:
├── sub-001
│   ├── anat
│   │   └── sub-001_T1w.nii
│   └── func
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_physio.json
│       └── sub-001_task-rest_run-2_physio.tsv.gz
:

Tree 5

rt-me-fMRI
.
├── README
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── task-emotionProcessingImagined_events.json
├── task-emotionProcessing_events.json
├── task-fingerTappingImagined_events.json
├── task-fingerTapping_events.json
├── sub-001
│   ├── anat
│   │   └── sub-001_T1w.nii
│   └── func
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_events.tsv
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.json
│       ├── sub-001_task-emotionProcessing_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTappingImagined_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_events.tsv
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.json
│       ├── sub-001_task-fingerTapping_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-1_physio.tsv.gz
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-1_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-2_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.json
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_echo-3_bold.nii
│       ├── sub-001_task-rest_run-2_physio.json
│       └── sub-001_task-rest_run-2_physio.tsv.gz
├── sub-002
:       :
├── sub-032
└── derivatives
    ├── fmrwhy-dash
    └── fmrwhy-qc
        ├── sub-001
        │   ├── anat
        │   ├── func
        │   └── report_[yyyymmddhhmmss]
        │       ├── assets
        │       ├── img
        │       └── sub-001_desc-QCreport_[yyyymmddhhmmss].html
        ├── sub-002
        :       :
        └── sub-032

Tree 6

rt-me-fMRI
.
├── README
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── task-emotionProcessingImagined_events.json
├── task-emotionProcessing_events.json
├── task-fingerTappingImagined_events.json
├── task-fingerTapping_events.json
├── sub-001
├── sub-002
├── sub-003
├── sub-004
├── sub-005
├── sub-006
├── sub-007
├── sub-010
├── sub-011
├── sub-012
├── sub-013
├── sub-015
├── sub-016
├── sub-017
├── sub-018
├── sub-019
├── sub-020
├── sub-021
├── sub-022
├── sub-023
├── sub-024
├── sub-025
├── sub-026
├── sub-027
├── sub-029
├── sub-030
├── sub-031
├── sub-032
└── derivatives
    ├── fmrwhy-dash
    └── fmrwhy-qc
        ├── sub-001
        │   ├── anat
        │   ├── func
        │   └── report_[yyyymmddhhmmss]
        │       ├── assets
        │       ├── img
        │       └── sub-001_desc-QCreport_[yyyymmddhhmmss].html
        ├── sub-002
        :       :
        └── sub-032