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const express = require("express");
const app = express();
const https = require("https");
const bodyParser = require("body-parser");
const fetch = require("node-fetch");
var posTagger = require("wink-pos-tagger");
var keyword_analyzer = require("keyword-analyzer");
const fs = require("fs");
const bcrypt = require("bcrypt");
const passport = require("passport");
const flash = require("express-flash");
const session = require("express-session");
const methodOverride = require("method-override");
const jsonfile = require("jsonfile");
const lineReader = require("line-reader");
var keyword_extractor = require("keyword-extractor");
const XMLExtract = require("xml-extract");
var utilisateurs;
const users = [];
app.use(bodyParser.urlencoded({ extended: true }));
jsonfile.readFile("users.json", function (err, obj) {
if (err) console.error(err);
users.push(obj);
utilisateurs = obj;
const initializePassport = require("./passport-config");
initializePassport(
passport,
(email) => utilisateurs.utilisateurs.find((user) => user.email === email),
(id) => utilisateurs.utilisateurs.find((user) => user.id === id)
);
});
app.set("view-engine", "ejs");
app.use(express.urlencoded({ extended: false }));
app.use(flash());
app.use(
session({
secret: "10",
resave: false,
saveUninitialized: false,
})
);
app.use(passport.initialize());
app.use(passport.session());
app.use(methodOverride("_method"));
app.get("/", checkAuthenticated, (req, res) => {
res.render("index.ejs", { name: req.user.name, niveau: req.user.nivExp });
});
app.get("/login", checkNotAuthenticated, (req, res) => {
res.render("login.ejs");
});
app.post(
"/login",
checkNotAuthenticated,
passport.authenticate("local", {
successRedirect: "/",
failureRedirect: "/login",
failureFlash: true,
})
);
app.get("/register", checkNotAuthenticated, (req, res) => {
res.render("register.ejs");
});
app.post("/register", checkNotAuthenticated, async (req, res) => {
try {
const hashedPassword = await bcrypt.hash(req.body.password, 10);
let data = {
id: Date.now().toString(),
name: req.body.name,
email: req.body.email,
password: hashedPassword,
nivExp: req.body.niv,
requetes: [],
};
utilisateurs.utilisateurs.push(data);
// console.log(data);
let json = JSON.stringify(utilisateurs, null, 2);
fs.writeFileSync("users.json", json, "utf8", () => console.log("saved!"));
res.redirect("/login");
} catch {
res.redirect("/register");
}
});
app.delete("/logout", (req, res) => {
req.logOut();
res.redirect("/login");
});
function checkAuthenticated(req, res, next) {
if (req.isAuthenticated()) {
return next();
}
res.redirect("/login");
}
function checkNotAuthenticated(req, res, next) {
if (req.isAuthenticated()) {
return res.redirect("/");
}
next();
}
// end login-registration
// css js
app.use(express.static(__dirname + "/public"));
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU DEBUTANT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU INTERMEDIAIRE
function getLemma(requete) {
//fonction ta3tik tableau racines el mots li mawjoudin f requete initiale
var tagger = posTagger();
var analyse = tagger.tagSentence(requete); //ta3ti kal objet ba3d l'analyse eli fih barcha attributs
var lemmatized = []; //tableau bech n7ot fih el lemma
//fonction win nal9a lemma n7otha f tableau
analyse.forEach((element) => {
if (element.lemma) {
lemmatized.push(element.lemma);
}
});
return lemmatized;
}
const getTermeApi = async (url) => {
//fonction traja3lek terme medical mel api mesh ki ta3teha url
const response = await fetch(url);
const json = await response.json();
return json;
};
async function getTermes(lemmatized) {
//fonction ta3tik tableau termes medicaux ki ta3teha tableau mta3 les racines de mots de la requete initiale
let trouve = false; //ta3mel beha test ken l9it termes medicaux wala le
var urlmesh = "https://id.nlm.nih.gov/mesh/lookup/term?limit=3&label=";
var termes = []; //tableau fih termes
if (lemmatized == 0) {
return termes;
}
// njarbou mots composés bou 3
else {
if (lemmatized.length > 2) {
var i = 0;
do {
// await https.get(urlmesh+lemmatized[i]+" "+lemmatized[i+1]+" "+lemmatized[i+2]+ "&match=contains", function(response){
// response.on("data", function(data){
// var terme =(JSON.parse(data));
let terme = await getTermeApi(
urlmesh +
lemmatized[i] +
" " +
lemmatized[i + 1] +
" " +
lemmatized[i + 2] +
"&match=exact"
);
if (terme.length > 0) {
trouve = true; //ken trouve true ma ya3malch mots composés bou zouz 5ater l9ina fel 3
terme.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
} else {
let termeContain = await getTermeApi(
urlmesh +
lemmatized[i] +
" " +
lemmatized[i + 1] +
" " +
lemmatized[i + 2] +
"&match=contains"
);
if (termeContain.length > 0) {
trouve = true; //ken trouve true ma ya3malch mots composés bou zouz 5ater l9ina fel 3
termeContain.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
}
}
// })
// })
i++;
} while (i < lemmatized.length - 2);
}
// njarbou mots composés bou zouz ken bou 3 ma mchech
if ((trouve == false && lemmatized.length > 2) || lemmatized.length == 2) {
var j = 0;
do {
const terme = await getTermeApi(
urlmesh + lemmatized[j] + " " + lemmatized[j + 1] + "&match=exact"
);
if (terme.length > 0) {
trouve = true;
terme.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
} else {
let termeContain = await getTermeApi(
urlmesh +
lemmatized[j] +
" " +
lemmatized[j + 1] +
"&match=contains"
);
if (termeContain.length > 0) {
trouve = true; //ken trouve true ma ya3malch mots composés bou zouz 5ater l9ina fel 3
termeContain.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
}
}
j++;
} while (j < lemmatized.length - 1);
}
//njarbou el kelmet simples ken bou zouz ma mchech
if (trouve == false) {
var k = 0;
do {
const terme = await getTermeApi(
urlmesh + lemmatized[k] + "&match=exact"
);
if (terme.length > 0) {
trouve = true;
terme.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
} else {
let termeContain = await getTermeApi(
urlmesh + lemmatized[k] + "&match=contains"
);
if (termeContain.length > 0) {
trouve = true; //ken trouve true ma ya3malch mots composés bou zouz 5ater l9ina fel 3
termeContain.forEach((element) => {
termes.push(element.label);
});
}
}
k++;
} while (k < lemmatized.length);
}
return termes;
}
}
const getNomArticleApi = async (terme) => {
//fonction tjiblek esm el article men api wikipedia ki ta3teha terme medical
let url1 =
"https://en.wikipedia.org/w/api.php?action=opensearch&search=" + terme;
const response = await fetch(url1);
const json = await response.json();
return json[1][0];
};
const getArticleApi = async (nomArticle) => {
//fonction tjiblek el article men api wikipedia ki ta3teha esm l'article
let url2 =
"https://en.wikipedia.org/w/api.php?action=query&prop=extracts&format=json&titles=" +
nomArticle +
"&explaintext=true";
const response = await fetch(url2);
const json = await response.json();
var article = json.query.pages[Object.keys(json.query.pages)].extract;
return article;
};
async function getArticle(terme) {
//fonction traja3lek article ki ta3teha el terme
let nomArticle = await getNomArticleApi(terme);
let article = await getArticleApi(nomArticle);
return article;
}
async function getArticles(termes) {
// fonction tjib tableau mta3 articles ki ta3teha el tableau mta3 termes
let articles = [];
i = 0;
do {
let article = await getArticle(termes[i]);
articles.push(article);
i++;
} while (i <= termes.length);
return articles;
}
function getMotsFrequents(articles) {
//fonction extraire les mots frequents des articles, t7ot l'articles lkol fi chaine wa7da w te5dem 3lehom
var articleTotal = "";
articles.forEach((element) => {
articleTotal = articleTotal + element;
});
// console.log(articleTotal);
return keyword_analyzer.wrest(articleTotal, {
limit: 10,
stopWords: ["undefined", "Undefined", "variable", "function"],
});
}
function filtrer(tableau) {
var tabFinal = [];
var temp = [];
tableau.forEach((element) => {
element.replace(",", "");
temp = element.split(" ");
tabFinal = [...tabFinal, ...temp];
});
return tabFinal;
}
function reformulation(requete, freq) {
//fonction reformulation requete
let requeteFinale = requete;
freq.forEach((element) => {
if (requeteFinale.toLowerCase().includes(element.toLowerCase()) === false) {
requeteFinale = requeteFinale + " " + element;
}
});
if (requeteFinale.length > requete.length) {
return requeteFinale;
} else {
return requete;
}
}
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
// FONCTIONS POUR LE NIVEAU EXPERT
var readTextFile = require("read-text-file");
function getParRegex(recherche) {
//retourner tableau contenant les ligne où existe le parametre entré
let expression = ".*#abc.*\\b";
let newEx = expression.replace("#abc", recherche);
let REGEX = new RegExp(newEx, "g");
return contents.match(REGEX);
}
const contents = readTextFile.readSync("meshTree.txt");
function getTabSansOccurences(matrice) {
//tna7i l'occurences li mawjoudin fel matrice w t7ot lbe9i f tab
let tabTotal = [];
matrice.forEach((element) => {
element.forEach((elt) => {
if (tabTotal.indexOf(elt) == -1) {
tabTotal.push(elt);
}
});
});
return tabTotal;
}
function rechercherTermesTree(termes) {
//retourne le tableau des termes existants dans l'arbre
let tab = [];
let tabTotal = [];
termes.forEach((element) => {
tab = getParRegex(element);
if (tab != null) {
tab.forEach((elt) => {
if (getLabel(elt) == element && tabTotal.indexOf(elt) == -1) {
tabTotal.push(elt);
}
});
}
});
return tabTotal;
}
function getCode(term) {
//te5ou lcode men ligne ex "A02.513.514.100 Anterior Cruciate Ligament" traja3 A02.513.514.100
let i = 0;
let code = "";
while (term[i] != " ") {
code = code + term[i];
i++;
}
return code;
}
function getLabel(term) {
//te5ou el label men ligne ex "A02.513.514.100 Anterior Cruciate Ligament" traja3 Anterior Cruciate Ligament
let code = getCode(term);
term = term.replace(code, "");
term = term.trim();
return term;
}
function getFilles(code) {
let filles = [];
let result = [];
filles = getParRegex(code);
if (filles != []) {
filles.forEach((element) => {
if (getCode(element).length <= code.length + 4) {
result.push(getLabel(element));
}
});
}
return result;
}
//si getFilles(code) ==[]
function getMereSoeurs(code) {
let codeMere = code.slice(0, code.length - 4);
let result = [];
mereSoeurs = getParRegex(codeMere);
mereSoeurs.forEach((element) => {
if (
getCode(element).length <= code.length &&
getCode(element).length >= codeMere.length
) {
result.push(getLabel(element));
}
});
return result;
}
function getKolChay(tabTotal) {
let code;
let matrice = [];
let tabTermesGlobal = [];
let temp = [];
tabTotal.forEach((element) => {
code = getCode(element);
temp = getFilles(code);
if (temp.length == 1) {
matrice.push(getMereSoeurs(code));
} else {
matrice.push(temp);
}
// console.log(matrice);
});
tabTermesGlobal = getTabSansOccurences(matrice);
return tabTermesGlobal;
}
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
//FONCTIONS PRINCIPALES
app.post("/debutant", checkAuthenticated, async (req, res) => {
let requeteFinale = req.body.requeteDebutant;
let users = utilisateurs; //nhot tableau utilisateur f wost tableau users
for (var i = 0; i < users.utilisateurs.length; i++) {
if (users.utilisateurs[i].id === req.user.id) {
users.utilisateurs[i].requetes.push(requeteFinale);
let json = JSON.stringify(users, null, 2);
fs.writeFile("users.json", json, "utf8", () => console.log("saved!"));
}
}
lineReader.eachLine("indexniv1.txt", function (line) {
var extraction_result = keyword_extractor.extract(line, {
language: "english",
remove_digits: false,
return_changed_case: true,
remove_duplicates: false,
});
let indexArray = [];
indexArray = extraction_result;
console.log(extraction_result);
res.render("resDebutant.ejs", {
query: requeteFinale,
index: indexArray,
});
});
});
app.post("/intermidiare", checkAuthenticated, async (req, res, next) => {
try {
var requete = req.body.requete; //tjib eli tekteb fel input
var lemmatized = getLemma(requete); // les racines des mots de la requete initiale
// console.log(lemmatized);
var termes = await getTermes(lemmatized); //les termes medicaux
console.log(termes);
var articles = await getArticles(termes); //les articles wikipedia
var freq = getMotsFrequents(articles); //les mots frequents des articles
var requeteFinale = reformulation(requete, freq); //requete reformulée
console.log(requeteFinale);
} catch (err) {
next("no keywords to add from wikipedia, same request : " + requete);
}
res.render("resIntremidiaire.ejs", {
query1: requeteFinale,
indexes: indexArrayNiv2,
});
});
const requests = readTextFile.readSync(
"indexes/index__niv2/requests__niv2.txt"
);
const result = readTextFile.readSync("indexes/index__niv2/res__niv2.txt");
let indexArrayNiv2 = [];
app.post("/expert", checkAuthenticated, async (req, res) => {
var requete = req.body.requeteExpert; //tjib eli tekteb fel input
var lemmatized = getLemma(requete); // les racines des mots de la requete initiale
// console.log(lemmatized);
var termes = await getTermes(lemmatized); //les termes medicaux
// console.log(termes);
var tabTotal = rechercherTermesTree(termes);
console.log(tabTotal);
var kolChay = getKolChay(tabTotal);
var termesFinal = filtrer(kolChay);
console.log(termesFinal);
var requeteFinale = reformulation(requete, termesFinal); //requete reformulée
// console.log(requeteFinale);
res.render("resExpert.ejs", { query: requeteFinale });
});
app.listen(3000, function () {
console.log("server is on port 3000");
});