diff --git a/R/first_analysis_urchin_bio.R b/R/first_analysis_urchin_bio.R index 1e188d2..a83d055 100644 --- a/R/first_analysis_urchin_bio.R +++ b/R/first_analysis_urchin_bio.R @@ -1,15 +1,16 @@ -# Découverte du jeu de données portant sur la biometrue d'oursins +# Découverte du jeu de données portant sur la biometiue d'oursins # Author : ... # Date : 2018-09-.. # Importation des principaux outils permetant l'analyse des données SciViews::R +options(data.io_lang = "fr") # Importation des données -ub <- read(package = "data.io", "urchin_bio", lang = "fr") +urchin_bio <- read(package = "data.io", "urchin_bio") # Information sur le jeu de données dans R -about("ub") +about("urchin_bio") # Réalisation de graphique #### ## hauteur en fonction de la masse des oursins @@ -17,4 +18,5 @@ about("ub") ## parties solides en fonction du poids immergés + ## ... diff --git a/README.md b/README.md index cdcaaf8..eef1143 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -18,16 +18,16 @@ about("urchin_bio") Réalisez votre propre script et réalisez les graphiques suivants : - Représentez la variation de la hauteur en fonction de la masse des oursins + - Représentez la variation des parties solides en fonction du poids immergés des oursins -- Explorez par vous-même le jeu de données urchin_bio qui contient pas moins de 19 variables que vous pouvez tentez d’associer graphiquement. -Réalisez au moins 5 graphiques différents. +- Explorez par vous-même le jeu de données urchin_bio qui contient pas moins de 19 variables que vous pouvez tentez d’associer graphiquement. Réalisez au moins 5 graphiques différents. Vous trouvez à votre disposition dans le dossier `R` - Un script à compléter portant sur le jeu de données `urchin_bio` -Un exemple de script portant sur le jeu de données `iris` se trouve dans le dossier R du projet `sdd1_iris` +Un exemple de script portant sur le jeu de données `iris` se trouve dans le dossier R du projet [sdd1_iris](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_iris). ### Intégration des graphiques dans un rapport : Rmarkdown. @@ -38,6 +38,7 @@ Vous trouvez à votre disposition dans le dossier `analysis` - Intégrez vos graphiques les plus pertinent dans la section résultat de votre rapport d'analyse. - Débutez la rédaction de votre rapport en apportant une attention toute particulière à la rédaction correcte d'un rapport scientifique -Un exemple de rapport portant sur le jeu de données `iris` se trouve dans le dossier analysis du projet `sdd1_iris`. +Un exemple de rapport portant sur le jeu de données `iris` se trouve dans le dossier analysis du projet [sdd1_iris](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_iris). **Bonus : Tentez d'ajouter une image dans votre introduction de rapport** + diff --git a/analysis/bibliography/bibliography.bib b/analysis/bibliography/bibliography.bib new file mode 100644 index 0000000..607ae92 --- /dev/null +++ b/analysis/bibliography/bibliography.bib @@ -0,0 +1,9 @@ +@article{article, +author = {Grosjean, Philippe and Spirlet, Christine and Gosselin, Pol and Vaïtilingon, D and Jangoux, Michel}, +year = {1998}, +month = {12}, +pages = {1523-1531}, +title = {Land-based, closed-cycle echiniculture of Paracentrotus lividus (Lamarck) (Echinoidea: Echinodermata): A long-term experiment at a pilot scale}, +volume = {17}, +booktitle = {Journal of Shellfish Research} +} \ No newline at end of file diff --git a/analysis/bibliography/grosjean_1996_experimental_study_growth_paracentrotus_lividus.pdf b/analysis/bibliography/grosjean_1996_experimental_study_growth_paracentrotus_lividus.pdf deleted file mode 100644 index 8025d81..0000000 Binary files a/analysis/bibliography/grosjean_1996_experimental_study_growth_paracentrotus_lividus.pdf and /dev/null differ diff --git a/analysis/biometry_analysis.Rmd b/analysis/urchin_bio_analysis.Rmd similarity index 57% rename from analysis/biometry_analysis.Rmd rename to analysis/urchin_bio_analysis.Rmd index fc05f23..bea495a 100644 --- a/analysis/biometry_analysis.Rmd +++ b/analysis/urchin_bio_analysis.Rmd @@ -7,9 +7,11 @@ output: html_notebook ```{r setups} SciViews::R +options(data.io_lang = "fr") ``` + ```{r} -bio <- read("../data/biometry_2014.xlsx") +urchin_bio <- read(package = "data.io", "urchin_bio") ``` diff --git a/analysis/biometry_analysis.nb.html b/analysis/urchin_bio_analysis.nb.html similarity index 99% rename from analysis/biometry_analysis.nb.html rename to analysis/urchin_bio_analysis.nb.html index 658e8c2..2e397bf 100644 --- a/analysis/biometry_analysis.nb.html +++ b/analysis/urchin_bio_analysis.nb.html @@ -147,7 +147,7 @@ @@ -181,21 +181,22 @@

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SciViews::R
+ +
SciViews::R
+options(data.io_lang = "fr")
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bio <- read("../data/biometry_2014.xlsx")
+ +
urchin_bio <- read(package = "data.io", "urchin_bio")
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